RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MT-ND6P03923 174 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 S100PP25815 95 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP10-8P60410 259 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C1orf137Q5JT78 98 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPS10P5Q9NQ39 176 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERASQ7Z444 233 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q8IZM0 81 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HERVK_113P63121 156 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FABP9Q0Z7S8 132 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RHEBQ15382 184 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ANKRD39Q53RE8 183 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 REG3GQ6UW15 175 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 M0QXV9 152 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRSS2P07478 247 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A096LNJ9 63 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV7-43P04211 117 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 G0S2P27469 103 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CKS1BP61024 79 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SEC11AP67812 179 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FA2HQ7L5A8 372 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CST9LQ9H4G1 147 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LCE2BO14633 110 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COX19Q49B96 90 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 XAGE1AQ9HD64 81 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LRP2P98164 4655 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPINK8P0C7L1 97 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C18orf32Q8TCD1 76 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 F8VRH5 84 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBE2BP63146 152 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PMVKQ15126 192 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COX7B2Q8TF08 81 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 APOC3P02656 99 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PMCHL1Q16048 86 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDZD11Q5EBL8 140 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H0Y9J4 135 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C22orf24Q9Y442 160 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC01549A6NIU2 74 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CXCL5P42830 114 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DIRC1Q969H9 104 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 YPEL4Q96NS1 127 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLC3P0DOY3 106 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00614P0C842 121 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SNAPINO95295 136 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HBDP02042 147 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NDUFA6P56556 154 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RAB5BP61020 215 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SVBPQ8N300 66 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C11orf86A6NJI1 115 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H3BRM9 83 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SCO1O75880 301 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NDUFA5Q16718 116 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00167Q96N53 147 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GAGE10A6NGK3 116 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NUPR1O60356 82 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF861PO60384 105 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BAGE3Q86Y29 109 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LPAP08519 4548 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PFN2P35080 140 aa8.63□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATP5LO75964 103 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q8NDZ9 215 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.62□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BCE1O60756 84 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ERG28Q9UKR5 140 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RNF213Q63HN8 5207 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VPREB1P12018 145 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00310P59036 64 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM19A2Q8N3H0 131 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NKAPP1Q8N9T2 125 aa8.58□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.5 ms