RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428457.1

TNS3-204, Transcript of tensin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS3, Length 5,070 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS3-204ENST00000428457 SYCNQ0VAF6 134 aa7.2□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.2□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 COX8CQ7Z4L0 72 aa7.2□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.19□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 TLN2Q9Y4G6 2542 aa7.19□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.19□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 FSHBP01225 129 aa7.19□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.18□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 Q8N3U1 123 aa7.18□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 M0R2N4 97 aa7.18□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 Q8N814 137 aa7.18□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 AMELXQ99217 191 aa7.18□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 ADAMTS20P59510 1910 aa7.17□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 A0A1W2PPR1 153 aa7.16□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 PSPHP1O15172 72 aa7.16□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 PMAIP1Q13794 54 aa7.16□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 MUC7Q8TAX7 377 aa7.15□□□□□ -1.26
TNS3-204ENST00000428457 Q6ZSN1 163 aa7.15□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 Q8IZM0 81 aa7.15□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.14□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 C4orf26Q17RF5 130 aa7.14□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 ZNF462Q96JM2 2506 aa7.14□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.14□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.14□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa7.14□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 PRYO14603 147 aa7.14□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 CHD7Q9P2D1 2997 aa7.14□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 CYSRT1A8MQ03 144 aa7.13□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 M0R378 163 aa7.13□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.13□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 HTTP42858 3142 aa7.13□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 Q8N2B8 174 aa7.13□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 JMJD1CQ15652 2540 aa7.13□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 A8MTW9 85 aa7.12□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.12□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.12□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 PRR15LQ9BU68 103 aa7.12□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 ABCA12Q86UK0 2595 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 F8WDY8 70 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 COX17Q14061 63 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 C5orf42Q9H799 3197 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 SEC61GP60059 68 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 LINC01546A6NGU7 62 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.11□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 Q6ZVQ6 151 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 LINC00208Q96KT6 92 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 CRYGAP11844 174 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 RETNQ9HD89 108 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 COL4A2P08572 1712 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 EXPH5Q8NEV8 1989 aa7.1□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 PRO0628Q9UI54 55 aa7.09□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 CASC2Q6XLA1 102 aa7.09□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 Q8N9L7 120 aa7.09□□□□□ -1.27
TNS3-204ENST00000428457 PKD1L2Q7Z442 2459 aa7.08□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.08□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 LINC00575Q6W349 94 aa7.07□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.07□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.07□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 FHL3Q13643 280 aa7.07□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.06□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 LRRK2Q5S007 2527 aa7.06□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.06□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 LINC00315P59091 139 aa7.06□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 C1orf137Q5JT78 98 aa7.06□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 C6orf223Q8N319 242 aa7.06□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 PTPRBP23467 1997 aa7.05□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 Q6ZTC4 211 aa7.05□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.05□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 ESRGQ1W209 222 aa7.04□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.04□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 SPATA3Q8NHX4 192 aa7.03□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.03□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.03□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.02□□□□□ -1.28
TNS3-204ENST00000428457 Q9UF83 564 aa7.02□□□□□ -1.29
TNS3-204ENST00000428457 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa7.02□□□□□ -1.29
TNS3-204ENST00000428457 PCOTHQ58A44 107 aa7.02□□□□□ -1.29
TNS3-204ENST00000428457 POLQO75417 2590 aa7.02□□□□□ -1.29
TNS3-204ENST00000428457 FHL2Q14192 279 aa7.01□□□□□ -1.29
TNS3-204ENST00000428457 FASNP49327 2511 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
TNS3-204ENST00000428457 LAMA3Q16787 3333 aa7.01□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.3 ms