RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427644.1

LIMD1-AS1-201, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene LIMD1-AS1, Length 1,536 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KLK12Q9UKR0 248 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COX11Q9Y6N1 276 aa6.66□□□□□ -1.34
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C3orf84H3BNL1 204 aa6.65□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.65□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.65□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ENHOQ6UWT2 76 aa6.65□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RAB37Q96AX2 223 aa6.65□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SMIM13P0DJ93 91 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRR34Q9NV39 138 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.64□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GAGE12HA6NDE8 117 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM238C9JI98 176 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FOXI1Q12951 378 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CD164L2Q6UWJ8 174 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.63□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1B0GWB2 263 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C9orf118A6NHY6 69 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TIMM17BO60830 172 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MIAQ16674 131 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBE2WQ96B02 151 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPANXCQ9NY87 97 aa6.62□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 COX7A2LO14548 114 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NPC2P61916 151 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TTC32Q5I0X7 151 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DAND5Q8N907 189 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.61□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0U1RRA0 63 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RMI2Q96E14 147 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FBN3Q75N90 2809 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A4D1N5 150 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H3BUT2 72 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 APOMO95445 188 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CFC1BP0CG36 223 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CFC1P0CG37 223 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HERV-K104P63124 156 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KIAA0087Q14695 138 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CASC10Q5T4H9 136 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.6□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GHRHP01286 108 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRSS2P07478 247 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q8IZM0 81 aa6.59□□□□□ -1.35
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MALP21145 153 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 VAMP3Q15836 100 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C2orf82Q6UX34 121 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C1orf43Q9BWL3 253 aa6.58□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 RPL24P83731 157 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.57□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A1W2PPM0 123 aa6.56□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IFITM1P13164 125 aa6.56□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C6orf223Q8N319 242 aa6.56□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.56□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.56□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TSPAN13O95857 204 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CFAP161Q6P656 301 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00526Q96FQ7 95 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LYSTQ99698 3801 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 A0A0B4J2C4 111 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00158P58513 81 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPAG11BQ08648 103 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 Q9HAA7 133 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 ERG28Q9UKR5 140 aa6.55□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LY6G6CO95867 125 aa6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PFN2P35080 140 aa6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CKS1BP61024 79 aa6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UBE2V1Q13404 147 aa6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C10orf25Q5T742 122 aa6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SFTA2Q6UW10 78 aa6.54□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 CXCL5P42830 114 aa6.53□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.53□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.53□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.53□□□□□ -1.36
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 K7EP34 96 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 FABP2P12104 132 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 HIGD2BQ4VC39 106 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 C15orf56Q8N910 161 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.52□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 GAGE10A6NGK3 116 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 H7C2G1 150 aa6.51□□□□□ -1.37
LIMD1-AS1-201ENST00000427644 PSCAO43653 123 aa6.51□□□□□ -1.37
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