RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414773.5

CLGN-202, Transcript of calmegin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLGN, Length 2,820 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGN-202ENST00000414773 TAX1BP3O14907 124 aa7.33□□□□□ -1.24
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CLGN-202ENST00000414773 RAB37Q96AX2 223 aa7.33□□□□□ -1.24
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CLGN-202ENST00000414773 SPANXCQ9NY87 97 aa7.33□□□□□ -1.24
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CLGN-202ENST00000414773 A6NJY4 79 aa7.31□□□□□ -1.24
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CLGN-202ENST00000414773 C15orf56Q8N910 161 aa7.28□□□□□ -1.24
CLGN-202ENST00000414773 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
CLGN-202ENST00000414773 IFITM1P13164 125 aa7.28□□□□□ -1.24
CLGN-202ENST00000414773 CASC10Q5T4H9 136 aa7.28□□□□□ -1.24
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CLGN-202ENST00000414773 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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CLGN-202ENST00000414773 Q6ZRU5 148 aa7.23□□□□□ -1.25
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CLGN-202ENST00000414773 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa7.22□□□□□ -1.25
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CLGN-202ENST00000414773 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.21□□□□□ -1.25
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CLGN-202ENST00000414773 TTC32Q5I0X7 151 aa7.2□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.19□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 FABP2P12104 132 aa7.19□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 SYCNQ0VAF6 134 aa7.19□□□□□ -1.26
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CLGN-202ENST00000414773 Q1RN00 199 aa7.19□□□□□ -1.26
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CLGN-202ENST00000414773 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.18□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 XAGE1AQ9HD64 81 aa7.17□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 GAGE10A6NGK3 116 aa7.17□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 PSMB2P49721 201 aa7.17□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.17□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 CARD19Q96LW7 228 aa7.17□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 F8WDY8 70 aa7.16□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 UBE2V1Q13404 147 aa7.16□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 Q8NDZ9 215 aa7.16□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 K7EP34 96 aa7.16□□□□□ -1.26
CLGN-202ENST00000414773 LY6G6CO95867 125 aa7.15□□□□□ -1.26
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