RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411000.1

RNU6-172P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 172, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-172P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-172P-201ENST00000411000 GNG5P63218 68 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 UBE2L3P68036 154 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 PMS2P3Q13401 168 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM97Q5BJF2 176 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 SSR3Q9UNL2 185 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 G3V2T6 193 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 SPART-AS1P0CW21 52 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSPHP78330 225 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 SEC11CQ9BY50 192 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 PRNDQ9UKY0 176 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFT140Q96RY7 1462 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 MT-ATP8P03928 68 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 CSN2P05814 226 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 HLA-DRB4P13762 266 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 LTC4SQ16873 150 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 PTH2Q96A98 100 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 A2MP01023 1474 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 ERCC6Q03468 1493 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 A0A0G2JND7 137 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 S100A11P31949 105 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 TMEM128Q5BJH2 165 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 CLLU1Q5K131 121 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 S100A7L2Q5SY68 101 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC122Q5T0U0 273 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 C9orf153Q5TBE3 101 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMC1Q9NVT9 282 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 CEP250Q9BV73 2442 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 RGPD5Q99666 1765 aa-3.86□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 CCDC144AA2RUR9 1427 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARMS2P0C7Q2 107 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 TAC4Q86UU9 113 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 SERP2Q8N6R1 65 aa-3.87□□□□□ -3.03
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP-3.87□□□□□ -3.03
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RNU6-172P-201ENST00000411000 TRPC5OSA6NMA1 111 aa-3.88□□□□□ -3.03
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RNU6-172P-201ENST00000411000 ZFYVE9O95405 1425 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 IL5P05113 134 aa-3.91□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 MIC13Q5XKP0 118 aa-3.91□□□□□ -3.04
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RNU6-172P-201ENST00000411000 SMIM24O75264 130 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 LIN52Q52LA3 116 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 LEAP2Q969E1 77 aa-3.92□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-3.93□□□□□ -3.04
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RNU6-172P-201ENST00000411000 CETN3O15182 167 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 SNCGO76070 127 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 NDUFB6O95139 128 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 IFI6P09912 130 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 PSMG4Q5JS54 123 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 SYNJ1O43426 1573 aa-3.93□□□□□ -3.04
RNU6-172P-201ENST00000411000 NUP188Q5SRE5 1749 aa-3.94□□□□□ -3.04
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