RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379918.8

CAGE1-203, Transcript of cancer antigen 1, human

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAGE1, Length 2,877 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CAGE1-203	ENST00000379918	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CAGE1-203	ENST00000379918	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CAGE1-203	ENST00000379918	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CAGE1-203	ENST00000379918	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CAGE1-203	ENST00000379918	FBN3	Q75N90	2809 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	GYPE	P15421	78 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	CRP	P02741	224 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	TMEM86B	Q8N661	226 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	OR13C6P	Q8NH95	151 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	PAX4	O43316	350 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	ANK2	Q01484	3957 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	LECT2	O14960	151 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	DEFB121	Q5J5C9	76 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	OVOL2	Q9BRP0	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	NCR3	O14931	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	HERV-K104	P63124	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918		Q8NDZ9	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A087WZ39	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918		X6R8D5	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	TRAC	P01848	142 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	PF4	P02776	101 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	MAL	P21145	153 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	HTN3	P15516	51 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM240A	A0A1B0GVK7	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918	C16orf95	Q9H693	158 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A087WVE0	104 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	DNAL4	O96015	105 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	HILS1	P60008	231 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	C10orf25	Q5T742	122 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918		Q6Q795	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	IBA57-AS1	B1ANH7	110 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	SS18	Q15532	418 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00846	Q9NV44	126 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	KLK5	Q9Y337	293 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	KIAA0087	Q14695	138 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	CXCL5	P42830	114 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	F8	P00451	2351 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	REG3A	Q06141	175 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	LY6G6D	O95868	133 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	MRPL23	Q16540	153 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918		Q8IZM0	81 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918		A0A1B0GUV1	79 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	KLK12	Q9UKR0	248 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918		M0R2N4	97 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	ACYP1	P07311	99 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	INAFM2	P0DMQ5	153 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	DAD1	P61803	113 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	XAGE1A	Q9HD64	81 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	RETN	Q9HD89	108 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CAGE1-203	ENST00000379918	DNHD1	Q96M86	4753 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918		H0YGX0	51 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CAGE1-203	ENST00000379918	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65

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