RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373190.5

PTPRT-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,559 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-204ENST00000373190 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 CYSRT1A8MQ03 144 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 HILS1P60008 231 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 A0A096LNJ9 63 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 AMELXQ99217 191 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 PPDPFQ9H3Y8 114 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 C1orf137Q5JT78 98 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF843Q8N446 348 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 IL17DQ8TAD2 202 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00208Q96KT6 92 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV4-31P0DP07 118 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 COX6A2Q02221 97 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 PRM2P04554 102 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 CXCL6P80162 114 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 C10orf99Q6UWK7 81 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00846Q9NV44 126 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 ESRGQ1W209 222 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV1-40P01703 118 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00575Q6W349 94 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZVQ6 151 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 CRYGAP11844 174 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 C11orf71Q6IPW1 123 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00474Q9P2X8 69 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 LIMD2Q9BT23 127 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00482Q8N8I6 264 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01546A6NGU7 62 aa6.34□□□□□ -1.39
PTPRT-204ENST00000373190 C7orf33Q8WU49 177 aa6.34□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 H0Y9P7 68 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 SHISA2Q6UWI4 295 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 TRAV10A0A0B4J240 114 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF580Q9UK33 172 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 HCG22E2RYF7 251 aa6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 PRR3P79522 188 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 REG3GQ6UW15 175 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 ZNF702PQ9H963 129 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 AKAP13Q12802 2813 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 hDV103S1A0JD37 113 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 PLAC8L1A1L4L8 177 aa6.32□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 BEAN1Q3B7T3 259 aa6.31□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 C4orf26Q17RF5 130 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 PCOTHQ58A44 107 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 C19orf84I3L1E1 186 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 LINC00337Q8N6G1 96 aa6.3□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1B0GUV1 79 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 PRO0461Q9UI25 63 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRT-204ENST00000373190 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 F8WDY8 70 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 Q9BRP9 147 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 FASNP49327 2511 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 EDN2P20800 178 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 BCE1O60756 84 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 A8MTW9 85 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 A0A087WSZ3 146 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 FHL2Q14192 279 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 CENPEQ02224 2701 aa6.25□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 BRI3O95415 125 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 C6orf223Q8N319 242 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 SMIM29Q86T20 159 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.24□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 Q6ZSN1 163 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 LINC01006Q8NI28 216 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 C2orf48Q96LS8 159 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.23□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 SBSPONQ8IVN8 264 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 INAFM1C9JVW0 142 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRT-204ENST00000373190 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRT-204ENST00000373190 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRT-204ENST00000373190 CEP350Q5VT06 3117 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRT-204ENST00000373190 PCNTO95613 3336 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRT-204ENST00000373190 A0A0C4DFX4 3053 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRT-204ENST00000373190 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRT-204ENST00000373190 Q9UF83 564 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRT-204ENST00000373190 A0A1B0GU69 56 aa6.2□□□□□ -1.42
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