RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331222.5

CLN8-201, Transcript of CLN8, transmembrane ER and ERGIC protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLN8, Length 7,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8-201ENST00000331222 BEAN1Q3B7T3 259 aa7.68□□□□□ -1.18
CLN8-201ENST00000331222 LINC00208Q96KT6 92 aa7.68□□□□□ -1.18
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CLN8-201ENST00000331222 LRRK2Q5S007 2527 aa7.67□□□□□ -1.18
CLN8-201ENST00000331222 NRACQ8N912 160 aa7.66□□□□□ -1.18
CLN8-201ENST00000331222 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa7.66□□□□□ -1.18
CLN8-201ENST00000331222 Q9UF83 564 aa7.66□□□□□ -1.18
CLN8-201ENST00000331222 U3KQK5 164 aa7.66□□□□□ -1.18
CLN8-201ENST00000331222 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.66□□□□□ -1.18
CLN8-201ENST00000331222 BPTFQ12830 3046 aa7.66□□□□□ -1.18
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CLN8-201ENST00000331222 C11orf21Q9P2W6 132 aa7.65□□□□□ -1.18
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CLN8-201ENST00000331222 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.64□□□□□ -1.19
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CLN8-201ENST00000331222 CDH23Q9H251 3354 aa7.64□□□□□ -1.19
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CLN8-201ENST00000331222 IGKV2-30P06310 120 aa7.64□□□□□ -1.19
CLN8-201ENST00000331222 LINC00337Q8N6G1 96 aa7.64□□□□□ -1.19
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CLN8-201ENST00000331222 C2orf48Q96LS8 159 aa7.63□□□□□ -1.19
CLN8-201ENST00000331222 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.63□□□□□ -1.19
CLN8-201ENST00000331222 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.62□□□□□ -1.19
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CLN8-201ENST00000331222 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.61□□□□□ -1.19
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CLN8-201ENST00000331222 P0C879 139 aa7.61□□□□□ -1.19
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CLN8-201ENST00000331222 NAV2Q8IVL1 2488 aa7.6□□□□□ -1.19
CLN8-201ENST00000331222 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
CLN8-201ENST00000331222 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.6□□□□□ -1.19
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CLN8-201ENST00000331222 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP7.59□□□□□ -1.19
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CLN8-201ENST00000331222 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.56□□□□□ -1.2
CLN8-201ENST00000331222 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.56□□□□□ -1.2
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CLN8-201ENST00000331222 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.55□□□□□ -1.2
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CLN8-201ENST00000331222 Q8N6K4 173 aa7.53□□□□□ -1.2
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CLN8-201ENST00000331222 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.51□□□□□ -1.21
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CLN8-201ENST00000331222 IGLV1-51P01701 117 aa7.5□□□□□ -1.21
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CLN8-201ENST00000331222 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.49□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 IGIPA6NJ69 53 aa7.48□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 Q8N3U1 123 aa7.48□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 DNAH14Q0VDD8 3507 aa7.48□□□□□ -1.21
CLN8-201ENST00000331222 C22orf24Q9Y442 160 aa7.48□□□□□ -1.21
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