RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 C18orf65Q6ZTR6 163 aa3.51□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 KLK15Q9H2R5 256 aa3.51□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 H3BUA1 57 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 C8orf49Q96NF6 230 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 PRM2P04554 102 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 CRIP1P50238 77 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 LITAFQ99732 161 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 C14orf132Q9NPU4 83 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 APCP25054 2843 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 A0A0J9YXY3 114 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 CLPSL1A2RUU4 121 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 NDUFA4O00483 81 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 SOCS3O14543 225 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 KLK9Q2XQG4 91 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 C19orf73Q9NVV2 129 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 WFDC9Q8NEX5 89 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 ACANP16112 2415 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 A0A096LNT2 108 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 MIAQ16674 131 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 Q6ZSV7 163 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 SMIM2Q9BVW6 85 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 MTORP42345 2549 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 A0A0J9YXV3 536 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 PRAC2D3DTV9 90 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 Q9HAA7 133 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 ITPR3Q14573 2671 aa3.49□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.48□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.48□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 J3QKU1 62 aa3.48□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 K7EQG2 157 aa3.48□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 C2orf66Q6UXQ4 117 aa3.48□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 IGLV1-40P01703 118 aa3.48□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.48□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.48□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 Q75L30 129 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 FASNP49327 2511 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 C3orf84H3BNL1 204 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 C10orf99Q6UWK7 81 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 Q6YL49 198 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 C1orf64Q8NEQ6 169 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 UBL5Q9BZL1 73 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 SORL1Q92673 2214 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 PSCAO43653 123 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 TENM4Q6N022 2769 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 CR1P17927 2039 aa3.47□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 PLA2G2AP14555 144 aa3.46□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 GYPEP15421 78 aa3.46□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 NREPQ16612 68 aa3.46□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
CLVS1-201ENST00000325897 ITPR2Q14571 2701 aa3.46□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 LIMD2Q9BT23 127 aa3.46□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 MSRB1Q9NZV6 116 aa3.46□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF580Q9UK33 172 aa3.46□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 HECTD1Q9ULT8 2610 aa3.46□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 WNK1Q9H4A3 2382 aa3.46□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa3.46□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 FAM30AQ9NZY2 134 aa3.46□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 UNC79Q9P2D8 2635 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 FSHBP01225 129 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB1P60022 68 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF702PQ9H963 129 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 HIVEP2P31629 2446 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 TSHBP01222 138 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 NOTCH3Q9UM47 2321 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 SCXQ7RTU7 201 aa3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.44□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 MOBPQ13875 183 aa3.44□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 DEFB136Q30KP8 78 aa3.44□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa3.44□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.44□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa3.44□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 A0A087WW49 117 aa3.44□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.44□□□□□ -1.86
CLVS1-201ENST00000325897 MAP6D1Q9H9H5 199 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.6 ms