RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318129.5

GINS3-201, Transcript of GINS complex subunit 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS3, Length 2,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3-201ENST00000318129 Q5XG85 94 aa7.21□□□□□ -1.25
GINS3-201ENST00000318129 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.21□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 NPC2P61916 151 aa7.21□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 DAND5Q8N907 189 aa7.21□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 UPK3BQ9BT76 320 aa7.21□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.21□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 A0A087WWL8 130 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 F5H697 171 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 C20orf203Q8NBC4 194 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 C22orf24Q9Y442 160 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 COX7A2LO14548 114 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 TIRAPP58753 221 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 LYRM9A8MSI8 78 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 RS1O15537 224 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 DSCR8Q96T75 97 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 TIMM17BO60830 172 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 SERP2Q8N6R1 65 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 MRAPQ8TCY5 172 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 FAM104AQ969W3 186 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 M0QY20 66 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZTI0 123 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 Q8NAQ8 132 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 LINC00612Q8N6U2 182 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 TM2D3Q9BRN9 247 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.16□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 SPART-AS1P0CW21 52 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.15□□□□□ -1.26
GINS3-201ENST00000318129 RETNQ9HD89 108 aa7.15□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 NACAE9PAV3 2078 aa7.14□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 DEFB130BP0DP73 79 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 DEFB130AP0DP74 79 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 B9D2Q9BPU9 175 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 DEFB4AO15263 64 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3-53P01767 116 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 DAD1P61803 113 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 LINC00308Q8TCZ7 52 aa7.13□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.12□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 Q6JHZ5 121 aa7.12□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.12□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.12□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 NDUFA1O15239 70 aa7.11□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.11□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.11□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 USP17L23D6RBM5 183 aa7.11□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 MALP21145 153 aa7.11□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 A0A087WVE0 104 aa7.1□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.1□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.1□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 FHL2Q14192 279 aa7.1□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 Q6ZSN1 163 aa7.1□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 CELA1Q9UNI1 258 aa7.1□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 K7EQD1 137 aa7.1□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 A0A0J9YWU9 116 aa7.09□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa7.09□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa7.09□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 LINC00846Q9NV44 126 aa7.09□□□□□ -1.27
GINS3-201ENST00000318129 DNAL4O96015 105 aa7.08□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 Q9HAA7 133 aa7.08□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 PRO0628Q9UI54 55 aa7.08□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.08□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 PRO0255Q9UI72 69 aa7.08□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa7.07□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.07□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.07□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 EPM2AB3EWF7 344 aa7.07□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 NDUFC2O95298 119 aa7.07□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 PFN2P35080 140 aa7.07□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.07□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 COPS9Q8WXC6 57 aa7.06□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 Q9H8V8 135 aa7.06□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.06□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.06□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 A0A0U1RRA0 63 aa7.05□□□□□ -1.28
GINS3-201ENST00000318129 PAX4O43316 350 aa7.05□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.1 ms