RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000300057.4

MESP1-201, Transcript of mesoderm posterior bHLH transcription factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MESP1, Length 2,369 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MESP1-201ENST00000300057 COX6A2Q02221 97 aa15.07■□□□□ 0
MESP1-201ENST00000300057 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP15.07■□□□□ 0
MESP1-201ENST00000300057 LINC00612Q8N6U2 182 aa15.07■□□□□ 0
MESP1-201ENST00000300057 DAND5Q8N907 189 aa15.07■□□□□ 0
MESP1-201ENST00000300057 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa15.06■□□□□ 0
MESP1-201ENST00000300057 TRACP01848 142 aa15.06■□□□□ 0
MESP1-201ENST00000300057 APOC4P55056 127 aa15.06■□□□□ 0
MESP1-201ENST00000300057 WFDC9Q8NEX5 89 aa15.06■□□□□ 0
MESP1-201ENST00000300057 FAM222AQ5U5X8 452 aa15.05■□□□□ 0
MESP1-201ENST00000300057 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa15.05■□□□□ 0
MESP1-201ENST00000300057 ATOX1O00244 68 aa15.05■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 TIRAPP58753 221 aa15.05■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 LINC00242Q5T6M2 205 aa15.05■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 C2orf48Q96LS8 159 aa15.05■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP15.05■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 NDUFA1O15239 70 aa15.04■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 INAFM2P0DMQ5 153 aa15.04■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 OR13C6PQ8NH95 151 aa15.04■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa15.03■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 BAALC-AS2P0C853 105 aa15.03■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 COPS9Q8WXC6 57 aa15.03■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
MESP1-201ENST00000300057 GYPEP15421 78 aa15.02□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 LINC00308Q8TCZ7 52 aa15.02□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa15.01□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa15□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 LYRM9A8MSI8 78 aa14.99□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa14.99□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa14.98□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 WIPF1O43516 503 aa14.98□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa14.98□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa14.97□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 PRO0255Q9UI72 69 aa14.97□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa14.96□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 A0A096LPF7 62 aa14.96□□□□□ -0.01
MESP1-201ENST00000300057 hADV29S1A0JD25 119 aa14.95□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 OXLD1Q5BKU9 147 aa14.95□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 C22orf24Q9Y442 160 aa14.95□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 SMIM1B2RUZ4 78 aa14.95□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 Q8NAQ8 132 aa14.94□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 CELA1Q9UNI1 258 aa14.94□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa14.93□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 PAX4O43316 350 aa14.93□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 TMEM258P61165 79 aa14.93□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 DAD1P61803 113 aa14.93□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 Q9H8V8 135 aa14.92□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 MIFP14174 115 aa14.92□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 F5H768 121 aa14.91□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 CYSRT1A8MQ03 144 aa14.9□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 MALP21145 153 aa14.9□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
MESP1-201ENST00000300057 DPH3Q96FX2 82 aa14.89□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.89□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 SERP2Q8N6R1 65 aa14.89□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 FAM218AQ96MZ4 157 aa14.89□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 KRTAP10-11P60412 298 aa14.88□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 PRIMA1Q86XR5 153 aa14.88□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 DNAL4O96015 105 aa14.87□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 HTN3P15516 51 aa14.87□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 A0A0U1RRA0 63 aa14.86□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 Q6JHZ5 121 aa14.86□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 STAB1Q9NY15 2570 aa14.86□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 SPART-AS1P0CW21 52 aa14.85□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 CYSTM1Q9H1C7 97 aa14.84□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 RPL28P46779 137 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 UPK3BQ9BT76 320 aa14.83□□□□□ -0.03
MESP1-201ENST00000300057 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.83□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 Q9HAA7 133 aa14.83□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 CLPSL2Q6UWE3 100 aa14.82□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 RETNQ9HD89 108 aa14.82□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa14.81□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 TOMM7Q9P0U1 55 aa14.81□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa14.8□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa14.8□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 MAST4O15021 2626 aa14.79□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 A0A1B0GUV1 79 aa14.79□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 COX7B2Q8TF08 81 aa14.79□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa14.78□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa14.77□□□□□ -0.04
MESP1-201ENST00000300057 XCL1P47992 114 aa14.77□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 USP17L23D6RBM5 183 aa14.76□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 CRPP02741 224 aa14.76□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa14.76□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 Q8N3U1 123 aa14.76□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 C14orf132Q9NPU4 83 aa14.76□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 LINC00846Q9NV44 126 aa14.76□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 A0A087WZ39 114 aa14.75□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 SS18Q15532 418 aa14.75□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 DSCR8Q96T75 97 aa14.75□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 LINC01561Q8N1V8 128 aa14.74□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 H0YGX0 51 aa14.73□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 LINC00269Q8N2A0 174 aa14.73□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 CMYA5Q8N3K9 4069 aa14.73□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 OXTP01178 125 aa14.72□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 A0A087WVE0 104 aa14.71□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 ANGP03950 147 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
MESP1-201ENST00000300057 A0A087WYN8 130 aa14.7□□□□□ -0.06
MESP1-201ENST00000300057 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms