RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614428.4

ACACA-231, Transcript of acetyl-CoA carboxylase alpha, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACACA, Length 9,554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACACA-231	ENST00000614428	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-231	ENST00000614428	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-231	ENST00000614428	VCAN	P13611	3396 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-231	ENST00000614428	LINC01548	A6NM66	108 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-231	ENST00000614428	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACACA-231	ENST00000614428	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	RBM3	P98179	157 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	HTN3	P15516	51 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	RNF223	E7ERA6	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	SLURP1	P55000	103 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	RPL28	P46779	137 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	RBMY1F	Q15415	496 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	DEFB114	Q30KQ6	69 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	DAD1	P61803	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	RMI2	Q96E14	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	DEFB113	Q30KQ7	82 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	PFN2	P35080	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428		Q6JHZ5	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428		F8WEM9	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428		Q6ZS46	218 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	GYPE	P15421	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428		A0A1B0GUV1	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428		Q8IZM0	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428		A0A087WZ39	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	COX7C	P15954	63 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	LINC00315	P59091	139 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	LINC00526	Q96FQ7	95 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	XCL1	P47992	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	LINC01600	Q96MT4	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428		J3QKU1	62 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	LECT2	O14960	151 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	NKAPP1	Q8N9T2	125 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428		F8WDY8	70 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428		Q96MF0	132 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	TRBV10-3	A0A0K0K1G6	114 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ACACA-231	ENST00000614428	C14orf132	Q9NPU4	83 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	ZNF702P	Q9H963	129 aa		4.84	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	SPART-AS1	P0CW21	52 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	SHISA2	Q6UWI4	295 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428		Q8N2B8	174 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428		A0A1B0GW54	56 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428		F5H768	121 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	DEFB1	P60022	68 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	BCE1	O60756	84 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	SPRY2	O43597	315 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	IGHV4-31	P0DP07	118 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428		Q6ZTI0	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428		A8MTW9	85 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	C11orf72	Q8NBR9	251 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	HAMP	P81172	84 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	MIF	P14174	115 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ACACA-231	ENST00000614428	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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