RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000604081.1

HOXC-AS2-202, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

Gene HOXC-AS2, Length 2,090 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SCGB1C2P0DMR2 95 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.09□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
HOXC-AS2-202ENST00000604081 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q9H8V8 135 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 F5H768 121 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRO0255Q9UI72 69 aa13.08□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GYPEP15421 78 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.07□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FN1P02751 2386 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FAM222AQ5U5X8 452 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WFDC9Q8NEX5 89 aa13.06□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TCL1BO95988 128 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HERV-K104P63124 156 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q1RN00 199 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DEFB135Q30KP9 77 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COPS9Q8WXC6 57 aa13.05□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 H7C2G1 150 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 J3QR89 54 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ETDBQ3ZM63 59 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MTURNQ8N3F0 131 aa13.04□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PRIMA1Q86XR5 153 aa13.03□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NPC2P61916 151 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SH2D6Q7Z4S9 175 aa13.02□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PAX4O43316 350 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 WIPF1O43516 503 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HIVEP1P15822 2718 aa13.01□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MIFP14174 115 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MEIG1Q5JSS6 88 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DAND5Q8N907 189 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00308Q8TCZ7 52 aa13□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A1B0GUV1 79 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TMEM262E9PQX1 116 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DAD1P61803 113 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COX7B2Q8TF08 81 aa12.98□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 DEFB4AO15263 64 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 COX6CP09669 75 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATXN8Q156A1 80 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.97□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 VWFP04275 2813 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRIAP1O43715 76 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q8NAQ8 132 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.96□□□□□ -0.33
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A087WZ39 114 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A0U1RRA0 63 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATP5G1P05496 136 aa12.95□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SS18Q15532 418 aa12.94□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TENM1Q9UKZ4 2725 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 A0A096LPF7 62 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 M0QXV9 152 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PCP4P48539 62 aa12.93□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TEN1Q86WV5 123 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C9JAW5 83 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 FOXI1Q12951 378 aa12.92□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SLC25A20O43772 301 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C5orf38Q86SI9 138 aa12.91□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CELA1Q9UNI1 258 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC01620Q4KN68 170 aa12.9□□□□□ -0.34
HOXC-AS2-202ENST00000604081 PPDPFLQ8WWR9 84 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ATRQ13535 2644 aa12.89□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC01561Q8N1V8 128 aa12.88□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 XCL1P47992 114 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa12.87□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 C6orf226Q5I0X4 101 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 GAGE12HA6NDE8 117 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00158P58513 81 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC01600Q96MT4 127 aa12.85□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 HTN3P15516 51 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.84□□□□□ -0.35
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LST1O00453 97 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXC-AS2-202ENST00000604081 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXC-AS2-202ENST00000604081 CARD19Q96LW7 228 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SPATA25Q9BR10 227 aa12.83□□□□□ -0.36
HOXC-AS2-202ENST00000604081 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXC-AS2-202ENST00000604081 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
HOXC-AS2-202ENST00000604081 Q8IZM0 81 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXC-AS2-202ENST00000604081 LELP1Q5T871 98 aa12.82□□□□□ -0.36
HOXC-AS2-202ENST00000604081 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.3 ms