RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592582.5

SEH1L-210, Transcript of SEH1 like nucleoporin, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SEH1L, Length 4,072 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEH1L-210ENST00000592582 PAX4O43316 350 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 IGKV3-20P01619 116 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM86BQ8N661 226 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 UPK3BQ9BT76 320 aa4.36□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 K7EQG2 157 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 CFHR3Q02985 330 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 PRR9Q5T870 116 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF575Q86XF7 245 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 Q6YL49 198 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 MED13LQ71F56 2210 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 LECT2O14960 151 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 DEFB113Q30KQ7 82 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 TOMM7Q9P0U1 55 aa4.35□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa4.34□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 RPL28P46779 137 aaKnown RBP4.34□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 HAMPP81172 84 aa4.34□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 LITAFQ99732 161 aa4.34□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF292O60281 2723 aa4.34□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa4.34□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.34□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 Q5XG85 94 aa4.34□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 ENHOQ6UWT2 76 aa4.34□□□□□ -1.71
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SEH1L-210ENST00000592582 LINC00846Q9NV44 126 aa4.34□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 SPG11Q96JI7 2443 aa4.34□□□□□ -1.71
SEH1L-210ENST00000592582 IGF2RP11717 2491 aa4.34□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 VPS13CQ709C8 3753 aa4.34□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.34□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.34□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa4.34□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 CCKP06307 115 aa4.33□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 SPINK13Q1W4C9 94 aa4.33□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.33□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa4.33□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa4.33□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 DEFB131AP59861 70 aa4.33□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.33□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP4.33□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 MTORP42345 2549 aa4.33□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 CEP295Q9C0D2 2601 aa4.33□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 INSP01308 110 aa4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 FHL2Q14192 279 aa4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 ZNF843Q8N446 348 aa4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 LINC00315P59091 139 aa4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 RETNQ9HD89 108 aa4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 A8MZ25 164 aa4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 NCR3O14931 201 aa4.32□□□□□ -1.72
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SEH1L-210ENST00000592582 ZNF702PQ9H963 129 aa4.32□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 F8WEM9 126 aa4.31□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 BEAN1Q3B7T3 259 aa4.31□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 PRB1P04280 392 aa4.31□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa4.31□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 PDE6GP18545 87 aa4.31□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 STHQ8IWL8 128 aa4.31□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.31□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 H3BQ85 93 aa4.31□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.31□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.3□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.3□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.3□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 AKAP6Q13023 2319 aa4.3□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 SNURFQ9Y675 71 aa4.3□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 DMXL1Q9Y485 3027 aa4.29□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 PMAIP1Q13794 54 aa4.29□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.29□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 Q8N2B8 174 aa4.29□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.29□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.29□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 FSHBP01225 129 aa4.29□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 MIFP14174 115 aa4.29□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 COX7B2Q8TF08 81 aa4.29□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 C6orf226Q5I0X4 101 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 HILS1P60008 231 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 DAD1P61803 113 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 WFDC9Q8NEX5 89 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 LINC00467Q9BRT7 94 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.28□□□□□ -1.72
SEH1L-210ENST00000592582 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP4.28□□□□□ -1.721e-5■■■■□ 21.5
SEH1L-210ENST00000592582 A0A087WYN8 130 aa4.27□□□□□ -1.73
SEH1L-210ENST00000592582 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.27□□□□□ -1.73
SEH1L-210ENST00000592582 OXTP01178 125 aa4.27□□□□□ -1.73
SEH1L-210ENST00000592582 KLKP1Q107X0 134 aa4.27□□□□□ -1.73
SEH1L-210ENST00000592582 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.27□□□□□ -1.73
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