RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 GAGE12HA6NDE8 117 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 GCHFRP30047 84 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 CYCSP99999 105 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 COX6A2Q02221 97 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 REG3AQ06141 175 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF56Q15929 161 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 BATFQ16520 125 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 P01737 135 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 MT-ND4LP03901 98 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 GZMBP10144 247 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 CRIP1P50238 77 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 TMUB2Q71RG4 321 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 STPG4Q8N801 248 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 OR10D4PQ8NGN7 298 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 DERL1Q9BUN8 251 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 MED28Q9H204 178 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM167BQ9NRX6 74 aa5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 SH2D1AO60880 128 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 UPK1BO75841 260 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 PRSS3P2Q8NHM4 247 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 CYSLTR1Q9Y271 337 aa5.68□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 CXorf1O96002 111 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 RPS10P46783 165 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 Q86TA4 180 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 VAX2Q9UIW0 290 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 MUC2Q02817 5179 aa5.67□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 H7C1H1 209 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 PEX7O00628 323 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF726P1Q15940 193 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 IQCJQ1A5X6 159 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZRP5 223 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 FMC1Q96HJ9 113 aa5.66□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 A6NDN8 102 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 BCL2L11O43521 198 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 NDUFA6P56556 154 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 H2BFSP57053 126 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 IFITM3Q01628 133 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 HIGD2BQ4VC39 106 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 AP1S3Q96PC3 154 aa5.65□□□□□ -1.5
PTPRM-210ENST00000578916 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 C15orf56Q8N910 161 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 AQP10Q96PS8 301 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00474Q9P2X8 69 aa5.64□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 A0A096LNI7 61 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GUV1 79 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 COLCA2A8K830 154 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 FGF6P10767 208 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 CTRLP40313 264 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2G1P62253 170 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM243Q9BU79 118 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 GFRA4Q9GZZ7 299 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 MUC21A0A140T8X8 626 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 A0A1B0GWB2 263 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 UBE2L6O14933 153 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 SERF2P84101 59 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 LYRM7Q5U5X0 104 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 DPM2O94777 84 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 RIGQ13278 110 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 ANKRD29Q8N6D5 301 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 LTAP01374 205 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 CXCL1P09341 107 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 CACNG7P62955 275 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 MEIG1Q5JSS6 88 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 HIST3H2BBQ8N257 126 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 GNB1LQ9BYB4 327 aa5.6□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 A0A087WZ39 114 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 G3V3Q6 166 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 M0QY20 66 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 MGPP08493 103 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 C10orf91Q5T1B1 145 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 Q6ZVQ6 151 aa5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
PTPRM-210ENST00000578916 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.59□□□□□ -1.51
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