RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZSV7 163 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 A0A087WZ39 114 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 BRK1Q8WUW1 75 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 NDUFB1O75438 58 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 DEFB121Q5J5C9 76 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZQY7 126 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 COX6A2Q02221 97 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 IGF2RP11717 2491 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 CDSNQ15517 529 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
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PTPRM-205ENST00000577827 EDN2P20800 178 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.47□□□□□ -1.21
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PTPRM-205ENST00000577827 ODF3L2Q3SX64 289 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 Q8N814 137 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRM-205ENST00000577827 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 PTPRBP23467 1997 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRM-205ENST00000577827 J3QKU1 62 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 MIFP14174 115 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.46□□□□□ -1.22
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PTPRM-205ENST00000577827 SCXQ7RTU7 201 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 A0A087WYN8 130 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 M0R378 163 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 AVPP01185 164 aa7.44□□□□□ -1.22
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PTPRM-205ENST00000577827 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 LELP1Q5T871 98 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 C18orf65Q6ZTR6 163 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 LINC01561Q8N1V8 128 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRM-205ENST00000577827 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa7.43□□□□□ -1.22
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PTPRM-205ENST00000577827 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRM-205ENST00000577827 A0A1W2PPR1 153 aa7.42□□□□□ -1.22
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PTPRM-205ENST00000577827 SYCNQ0VAF6 134 aa7.4□□□□□ -1.22
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PTPRM-205ENST00000577827 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.39□□□□□ -1.23
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PTPRM-205ENST00000577827 WFDC10AQ9H1F0 79 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRM-205ENST00000577827 PCSK5Q92824 1860 aa7.37□□□□□ -1.23
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PTPRM-205ENST00000577827 Q8N2B8 174 aa7.36□□□□□ -1.23
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PTPRM-205ENST00000577827 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.35□□□□□ -1.23
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PTPRM-205ENST00000577827 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-205ENST00000577827 C14orf177Q52M58 125 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00575Q6W349 94 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-205ENST00000577827 LITAFQ99732 161 aa7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-205ENST00000577827 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
PTPRM-205ENST00000577827 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-205ENST00000577827 H0Y9J4 135 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-205ENST00000577827 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-205ENST00000577827 B9D2Q9BPU9 175 aa7.34□□□□□ -1.23
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