RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa3.89□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 DPM3Q9P2X0 92 aa3.89□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 J3QLW9 94 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 FXYD1O00168 92 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 LHBP01229 141 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1-16P04430 117 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 Q1T7F1 81 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 FAM104BQ5XKR9 115 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 MIR17HGQ75NE6 70 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa3.88□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1W2PS18 150 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 A6NN06 94 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 ODF3BA8MYP8 253 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 M0R135 149 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 LEPROTO15243 131 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1D-12P01611 117 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 CHTF8P0CG12 524 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 RBM3P98179 157 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF56Q15929 161 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 PATE2Q6UY27 113 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 FAM104AQ969W3 186 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 XAGE1AQ9HD64 81 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 KMT2AQ03164 3969 aa3.87□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 M0R1W7 72 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 CLEC2BQ92478 149 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 NABP2Q9BQ15 211 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 SLC50A1Q9BRV3 221 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 CELA1Q9UNI1 258 aa3.86□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 RHOHQ15669 191 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF497Q6ZNH5 498 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 NMES1Q9C002 83 aa3.85□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV3A0A0B4J244 114 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 RPL27AP46776 148 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 Q6P435 159 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 SCGB3A1Q96QR1 104 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 TTTY10Q9BZA0 68 aa3.84□□□□□ -1.79
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 C2orf70A6NJV1 201 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 IL4P05112 153 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 GCHFRP30047 84 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 CAV3P56539 151 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 KISS1Q15726 138 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 S100A7L2Q5SY68 101 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 SPANXN1Q5VSR9 72 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 REG3GQ6UW15 175 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 OCR1Q9BZK8 76 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00474Q9P2X8 69 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 SORL1Q92673 2214 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 PKHD1P08F94 4074 aa3.83□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 NPYP01303 97 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 PRH1P02810 166 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 FXYD7P58549 80 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 DYNLRB2Q8TF09 96 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 ABRACLQ9P1F3 81 aa3.82□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 TNCP24821 2201 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 C17orf98A8MV24 154 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 H3BSH0 61 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1-39P01597 117 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-11P01762 117 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1D-39P04432 117 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV1-8P0DP01 117 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 NPPCP23582 126 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 EDDM3BP56851 147 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 TSPEAR-AS2P59090 65 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP10-5P60370 271 aa3.81□□□□□ -1.8
TMOD3-209ENST00000561136 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.3 ms