RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558836.5

CUX1-217, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 5

Gene CUX1, Length 2,965 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-217ENST00000558836 F8WDY8 70 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 NOTCH1P46531 2555 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 PSMB2P49721 201 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 C5orf47Q569G3 176 aa7.49□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.48□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.48□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 TMEM243Q9BU79 118 aa7.48□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 X6R8D5 127 aa7.48□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.48□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 LITAFQ99732 161 aa7.48□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa7.47□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.47□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.47□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.47□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 ETDBQ3ZM63 59 aa7.47□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 FAM222AQ5U5X8 452 aa7.47□□□□□ -1.21
CUX1-217ENST00000558836 COL6A5A8TX70 2615 aa7.46□□□□□ -1.21
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CUX1-217ENST00000558836 HERVK_113P63121 156 aa7.45□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 ZFAND6Q6FIF0 208 aa7.45□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.45□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.44□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 SMIM1B2RUZ4 78 aa7.44□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 TCL1BO95988 128 aa7.44□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 Q1RN00 199 aa7.44□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 TMEM262E9PQX1 116 aa7.44□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.44□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
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CUX1-217ENST00000558836 IGHV3-33P01772 117 aa7.43□□□□□ -1.22
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CUX1-217ENST00000558836 TENM3Q9P273 2699 aa7.43□□□□□ -1.22
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CUX1-217ENST00000558836 OXLD1Q5BKU9 147 aa7.42□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.42□□□□□ -1.22
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CUX1-217ENST00000558836 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.42□□□□□ -1.22
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CUX1-217ENST00000558836 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
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CUX1-217ENST00000558836 PRIMA1Q86XR5 153 aa7.42□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 Q8N3U1 123 aa7.42□□□□□ -1.22
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CUX1-217ENST00000558836 CELA1Q9UNI1 258 aa7.42□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.41□□□□□ -1.22
CUX1-217ENST00000558836 C5orf38Q86SI9 138 aa7.41□□□□□ -1.22
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CUX1-217ENST00000558836 PRO0255Q9UI72 69 aa7.4□□□□□ -1.23
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CUX1-217ENST00000558836 WFDC9Q8NEX5 89 aa7.36□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.36□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 H7C423 109 aa7.36□□□□□ -1.23
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CUX1-217ENST00000558836 RNF183Q96D59 192 aa7.36□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 LYRM9A8MSI8 78 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 CLEC2BQ92478 149 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 ICOSQ9Y6W8 199 aa7.35□□□□□ -1.23
CUX1-217ENST00000558836 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.35□□□□□ -1.23
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