RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557061.5

PAPLN-210, Transcript of papilin, proteoglycan like sulfated glycoprotein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PAPLN, Length 3,709 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPLN-210ENST00000557061 TMEM258P61165 79 aa6.86□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.85□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.85□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 SPATA3Q8NHX4 192 aa6.85□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 NDUFA12Q9UI09 145 aa6.85□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 VPS13CQ709C8 3753 aa6.85□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.85□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 C6orf226Q5I0X4 101 aa6.85□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 Q9UF83 564 aa6.84□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 NOTCH1P46531 2555 aa6.84□□□□□ -1.31
PAPLN-210ENST00000557061 CRYGDP07320 174 aa6.84□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 TSHBP01222 138 aa6.83□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa6.83□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 I3L3M4 83 aa6.83□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 INSP01308 110 aa6.83□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.83□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 ODF3Q96PU9 254 aa6.83□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 FAM19A4Q96LR4 140 aa6.82□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa6.82□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 ATXN8Q156A1 80 aa6.82□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.82□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 TMEM141Q96I45 108 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 ATOX1O00244 68 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 IGHV3-30P01768 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 HTN3P15516 51 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 TMEM243Q9BU79 118 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 IGLV1-51P01701 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 SLC25A29Q8N8R3 303 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 LENEPQ9Y5L5 61 aa6.81□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 C9orf85Q96MD7 179 aa6.8□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 MAP6D1Q9H9H5 199 aa6.8□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 LINC01620Q4KN68 170 aa6.8□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 K7EQG2 157 aa6.8□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 PMAIP1Q13794 54 aa6.8□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 COX8CQ7Z4L0 72 aa6.8□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 IGIPA6NJ69 53 aa6.79□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 KRTAP10-3P60369 221 aa6.79□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 C20orf203Q8NBC4 194 aa6.79□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 TRGV2A0A075B6R0 118 aa6.79□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 A0A0J9YXY3 114 aa6.79□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 M0QY20 66 aa6.79□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 TRIAP1O43715 76 aa6.79□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 Q9H8V8 135 aa6.79□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 UBE2L6O14933 153 aa6.78□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 IGHV3-33P01772 117 aa6.78□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa6.78□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 UBE2D1P51668 147 aa6.78□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 DEFB135Q30KP9 77 aa6.78□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 LINC01561Q8N1V8 128 aa6.78□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 A0A0J9YX75 114 aa6.78□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 LEPROTO15243 131 aa6.78□□□□□ -1.32
PAPLN-210ENST00000557061 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 Q5XG85 94 aa6.77□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.77□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 TIMM17AQ99595 171 aa6.77□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa6.77□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.77□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.77□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.77□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 A0A096LPF7 62 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 ATP5G1P05496 136 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 DCANP1Q8TF63 244 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 CRYGAP11844 174 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 LINC00158P58513 81 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 LINC00467Q9BRT7 94 aa6.76□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 TMEM223A0PJW6 202 aa6.75□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 Q9HAA7 133 aa6.75□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.75□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 LINC00315P59091 139 aa6.75□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 RHOHQ15669 191 aa6.75□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.75□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.75□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 DNAL4O96015 105 aa6.75□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 DEFB130BP0DP73 79 aa6.75□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 DEFB130AP0DP74 79 aa6.75□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 KLLNB2CW77 178 aa6.74□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 SOCS3O14543 225 aa6.74□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 UBE2D3P61077 147 aa6.74□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 UBE2D2P62837 147 aa6.74□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 NXPH4O95158 308 aa6.74□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 ODF3L2Q3SX64 289 aa6.74□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 POM121L12Q8N7R1 296 aa6.74□□□□□ -1.33
PAPLN-210ENST00000557061 IMUPQ9GZP8 106 aa6.74□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.3 ms