RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.7	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984		A0A0B4J2C4	111 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984		H7C423	109 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	CRYGD	P07320	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	RNF125	Q96EQ8	232 aa		4.69	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3OR16-8	A0A075B7F1	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984		F5H768	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	TRIAP1	O43715	76 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	APOC4	P55056	127 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984		H3BT86	120 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984		Q1RN00	199 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	METTL26	Q96S19	204 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	RHPN1-AS1	Q9BWJ2	59 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		4.68	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984		H3BS24	57 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	SPRY2	O43597	315 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	SUMO2	P61956	95 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	MAP6D1	Q9H9H5	199 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	CRYGA	P11844	174 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	COX7C	P15954	63 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.67	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984		A0A0J9YWU9	116 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984		J3QQQ9	107 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	TSHB	P01222	138 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB135	Q30KP9	77 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	OXT	P01178	125 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	ATP5G1	P05496	136 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	RPL35A	P18077	110 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	C4orf26	Q17RF5	130 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	APRG1	Q8IVJ8	170 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	RPL39L	Q96EH5	51 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.66	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.65	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.65	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.65	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		4.65	□□□□□ -1.66
FGD4-215	ENST00000551984	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	DPH3	Q96FX2	82 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		4.65	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	ACYP1	P07311	99 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	LGALS3	P17931	250 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984		Q5XG85	94 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	LINC00643	Q86TS7	51 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	LST1	O00453	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984		K7EQG2	157 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	DEFB131A	P59861	70 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	TRAC	P01848	142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	TMEM258	P61165	79 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.63	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	COX6C	P09669	75 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	CXCL5	P42830	114 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	RNF182	Q8N6D2	247 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	DCANP1	Q8TF63	244 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	AGPAT4-IT1	Q9H0P7	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	LEPROT	O15243	131 aa		4.62	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984		M0R381	172 aa		4.61	□□□□□ -1.67
FGD4-215	ENST00000551984	ATOX1	O00244	68 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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