RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549308.5

PTPRR-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 1,603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-209ENST00000549308 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 UBE2WQ96B02 151 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 TTTY13Q9BZ97 58 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 TP73-AS1Q9UF72 201 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 ENHOQ6UWT2 76 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 BOD1L2Q8IYS8 172 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 UPK3BQ9BT76 320 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 PRR34Q9NV39 138 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 COL7A1Q02388 2944 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 J3QQQ9 107 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 C5orf38Q86SI9 138 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 DLEU1O43261 78 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.17□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF815PA8K554 130 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 MIAQ16674 131 aa8.16□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 A0A087WZ39 114 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 MUC7Q8TAX7 377 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 Q9H8V8 135 aa8.15□□□□□ -1.1
PTPRR-209ENST00000549308 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 COX7A2LO14548 114 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 LINC00587B1AMM8 73 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 CTAG1AP78358 180 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 FOXI1Q12951 378 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.14□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 MALP21145 153 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 C2orf91Q6ZV80 131 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 Q9HAA7 133 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.13□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 COX7B2Q8TF08 81 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 NDUFA12Q9UI09 145 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 APOMO95445 188 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 PRSS2P07478 247 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 ORAOV1Q8WV07 137 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 HIGD1BQ9P298 99 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 NDUFA1O15239 70 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 RMI2Q96E14 147 aa8.1□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 K7EP13 123 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 FBN3Q75N90 2809 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRR-209ENST00000549308 A0A0J9YXY3 114 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 CFAP161Q6P656 301 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 Q8IZM0 81 aa8.08□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 HERV-K104P63124 156 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 SPAG11BQ08648 103 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 HSD52Q0P140 79 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 BATFQ16520 125 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 HIST1H4GQ99525 98 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 M0R143 59 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 TTC32Q5I0X7 151 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 TMEM238C9JI98 176 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 CKS1BP61024 79 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.05□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 KIAA0087Q14695 138 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 TAL2Q16559 108 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 SFTA2Q6UW10 78 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.05□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 C3orf84H3BNL1 204 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 TM2D2Q9BX73 214 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 COX11Q9Y6N1 276 aa8.04□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 EREGO14944 169 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 GCSHP23434 173 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 CXCL5P42830 114 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 CASC10Q5T4H9 136 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 SNHG12Q9BXW3 62 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 TIMM17BO60830 172 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 HIGD2BQ4VC39 106 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRR-209ENST00000549308 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.8 ms