RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545193.5

GRSF1-208, Transcript of G-rich RNA sequence binding factor 1, human

TSL 2 BASIC

Gene GRSF1, Length 2,682 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFA12	Q9UI09	145 aa		11.17	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	ATXN8	Q156A1	80 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	DAND5	Q8N907	189 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		11.16	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193		K7EQD1	137 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		11.15	□□□□□ -0.62
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM262	E9PQX1	116 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		11.14	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE2B	Q13066	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE2E	Q4V326	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	GAGE2D	Q9UEU5	116 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	CLEC2B	Q92478	149 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		11.13	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	ICOS	Q9Y6W8	199 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV30	A0A0K0K1B3	111 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		11.12	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193		X6R8D5	127 aa		11.11	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV10-2	A0A0K0K1G8	114 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	WIPF1	O43516	503 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	SNCG	O76070	127 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	IFITM1	P13164	125 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	MIA	Q16674	131 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	C2orf82	Q6UX34	121 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193		A0A0U1RRA0	63 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	TTC32	Q5I0X7	151 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	SPANXA1	Q9NS26	97 aa		11.1	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193		H7C423	109 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	KIR2DL5B	Q8NHK3	375 aa		11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	11.09	□□□□□ -0.63
GRSF1-208	ENST00000545193	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	SMIM9	A6NGZ8	99 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193		M0QXV9	152 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	SPANXC	Q9NY87	97 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE2W	Q96B02	151 aa		11.08	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	DEFB130B	P0DP73	79 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	DEFB130A	P0DP74	79 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	APOC4	P55056	127 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	FHL2	Q14192	279 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	DEFB135	Q30KP9	77 aa		11.07	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	CYSRT1	A8MQ03	144 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	COX6A2	Q02221	97 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		11.06	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	COX6C	P09669	75 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM101	Q96IK0	257 aa		11.05	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		11.04	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		11.04	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00694	P0DN24	101 aa		11.03	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV4-30-4	P0DP06	118 aa		11.03	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		11.03	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193		Q6Q795	121 aa		11.03	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	C3orf56	Q8N813	242 aa		11.03	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193	OXLD1	Q5BKU9	147 aa		11.02	□□□□□ -0.64
GRSF1-208	ENST00000545193		Q9H8V8	135 aa		11.02	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		11.02	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	LST1	O00453	97 aa		11.02	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	FAM222A	Q5U5X8	452 aa		11.02	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		11.02	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	DEFB4A	O15263	64 aa		11.01	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	TRAV13-1	A0A0B4J241	112 aa		11	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	LYRM9	A8MSI8	78 aa		11	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	PRIMA1	Q86XR5	153 aa		11	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	IGHV4-28	A0A0C4DH34	117 aa		11	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	NDUFA1	O15239	70 aa		11	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	11	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC01600	Q96MT4	127 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	TMEM243	Q9BU79	118 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193		H3BT86	120 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	LINC00308	Q8TCZ7	52 aa		10.99	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	KRTAP10-11	P60412	298 aa		10.98	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	10.98	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	UBE2L6	O14933	153 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	TIRAP	P58753	221 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193		Q8NAQ8	132 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	TIMM17B	O60830	172 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	MIF	P14174	115 aa		10.97	□□□□□ -0.65
GRSF1-208	ENST00000545193	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		10.96	□□□□□ -0.66
GRSF1-208	ENST00000545193	PRO0255	Q9UI72	69 aa		10.96	□□□□□ -0.66

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