RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544125.1

MDM2-231, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 2

Gene MDM2, Length 649 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-231	ENST00000544125		U3KQA8	63 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ABCC5	O15440	1437 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	NSD3	Q9BZ95	1437 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		0.18	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PARP14	Q460N5	1801 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	DOPEY2	Q9Y3R5	2298 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		A0A0G2JND7	137 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	COX6B1	P14854	86 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	WFDC2	Q14508	124 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PYY3	Q5JQD4	70 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		Q5VSD8	79 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	USMG5	Q96IX5	58 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	LINC01600	Q96MT4	127 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PTPRQ	Q9UMZ3	2332 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	SPEF2	Q9C093	1822 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	HMGXB3	Q12766	1538 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ZFYVE16	Q7Z3T8	1539 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	CCNB3	Q8WWL7	1395 aa		0.17	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	KMT2D	O14686	5537 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PHLPP1	O60346	1717 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	C10orf142	B7Z368	130 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		H7BZZ5	65 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		I3L2K1	104 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	SPINK4	O60575	86 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ARMS2	P0C7Q2	107 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	COX8A	P10176	69 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	GNGT1	P63211	74 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ETDB	Q3ZM63	59 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	DEFB123	Q8N688	67 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	LCN9	Q8WX39	176 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125		V9GYS6	101 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	IGF2R	P11717	2491 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PIEZO1	Q92508	2521 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	CCDC141	Q6ZP82	1450 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		0.16	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		0.15	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	SETBP1	Q9Y6X0	1596 aa		0.15	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	PATJ	Q8NI35	1801 aa		0.15	□□□□□ -2.38
MDM2-231	ENST00000544125	MYH8	P13535	1937 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125		A0A1B0GU69	56 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125		D6R8Y8	96 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125		H0Y9P7	68 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SYS1-DBNDD2	H3BUS1	97 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	LEPROTL1	O95214	131 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SPRR1A	P35321	89 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	CRIPT	Q9P021	101 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	RABAC1	Q9UI14	185 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PTPN13	Q12923	2485 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	USF3	Q68DE3	2245 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	IFT172	Q9UG01	1749 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ADGRL2	O95490	1459 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		0.15	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	DNAJC13	O75165	2243 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	DOCK1	Q14185	1865 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ABCC2	Q92887	1545 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125		A0A087WVE0	104 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PVALEF	A0A1B0GWK0	134 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PEA15	Q15121	130 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	POLQ	O75417	2590 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	MYOM1	P52179	1685 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		0.14	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	LRP6	O75581	1613 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	PRDM2	Q13029	1718 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	DOCK2	Q92608	1830 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125		F8WEM9	126 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125		I3L3M4	83 aa		0.13	□□□□□ -2.39
MDM2-231	ENST00000544125		K7EQZ3	153 aa		0.13	□□□□□ -2.39

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