RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542570.5

TOP3A-208, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOP3A, Length 4,116 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-208ENST00000542570 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
TOP3A-208ENST00000542570 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.28□□□□□ -1.24
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TOP3A-208ENST00000542570 KRTAP10-3P60369 221 aa7.28□□□□□ -1.24
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TOP3A-208ENST00000542570 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.28□□□□□ -1.24
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TOP3A-208ENST00000542570 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.26□□□□□ -1.25
TOP3A-208ENST00000542570 POM121L12Q8N7R1 296 aa7.26□□□□□ -1.25
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TOP3A-208ENST00000542570 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
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TOP3A-208ENST00000542570 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-208ENST00000542570 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-208ENST00000542570 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-208ENST00000542570 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.24□□□□□ -1.25
TOP3A-208ENST00000542570 IGIPA6NJ69 53 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-208ENST00000542570 TAX1BP3O14907 124 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-208ENST00000542570 SLC25A20O43772 301 aa7.23□□□□□ -1.25
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TOP3A-208ENST00000542570 C11orf72Q8NBR9 251 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-208ENST00000542570 NCR3O14931 201 aa7.23□□□□□ -1.25
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TOP3A-208ENST00000542570 LINC00315P59091 139 aa7.23□□□□□ -1.25
TOP3A-208ENST00000542570 A0A0J9YXY3 114 aa7.22□□□□□ -1.25
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TOP3A-208ENST00000542570 UBE2D2P62837 147 aa7.22□□□□□ -1.25
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TOP3A-208ENST00000542570 Q8N3U1 123 aa7.22□□□□□ -1.25
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TOP3A-208ENST00000542570 COX6A2Q02221 97 aa7.22□□□□□ -1.25
TOP3A-208ENST00000542570 PTH2Q96A98 100 aa7.22□□□□□ -1.25
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TOP3A-208ENST00000542570 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 CLEC2BQ92478 149 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 ATXN8Q156A1 80 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.21□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 SIVA1O15304 175 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 WFDC2Q14508 124 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 TMEM223A0PJW6 202 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 FAM19A4Q96LR4 140 aa7.2□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.19□□□□□ -1.26
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TOP3A-208ENST00000542570 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.18□□□□□ -1.26
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TOP3A-208ENST00000542570 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.18□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 K7EP34 96 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 WFDC10BQ8IUB3 73 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 RNF183Q96D59 192 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 SIGMAR1Q99720 223 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 SCGB1A1P11684 91 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 CARD19Q96LW7 228 aa7.17□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 PRR3P79522 188 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 TAL2Q16559 108 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 UBE2BP63146 152 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 NDUFA1O15239 70 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 TSPAN13O95857 204 aa7.16□□□□□ -1.26
TOP3A-208ENST00000542570 UBE2D1P51668 147 aa7.16□□□□□ -1.26
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