RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 ZNF815PA8K554 130 aa1.14□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 MGPP08493 103 aa1.14□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 HAMPP81172 84 aa1.14□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 SCRIBQ14160 1630 aa1.14□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 A0A1B0GWA3 101 aa1.13□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 SMIM11AP58511 58 aa1.13□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 TDRG1Q3Y452 100 aa1.13□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 HIGD1BQ9P298 99 aa1.13□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa1.13□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 CCDC18Q5T9S5 1454 aa1.12□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 PLIN4Q96Q06 1357 aa1.12□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 C7orf77A4D0Y5 90 aa1.12□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 PSMG4Q5JS54 123 aa1.12□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 Q6JHZ5 121 aa1.12□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 ZNF720Q7Z2F6 126 aa1.12□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 S100A13Q99584 98 aa1.12□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 RABAC1Q9UI14 185 aa1.12□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 NAV3Q8IVL0 2385 aa1.12□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 FBN3Q75N90 2809 aa1.11□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 BCE1O60756 84 aa1.11□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 JMJD1CQ15652 2540 aa1.1□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP1.1□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 H3BQF6 201 aa1.1□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 LRP6O75581 1613 aa1.1□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 MED14O60244 1454 aa1.1□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 ASXL3Q9C0F0 2248 aa1.09□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa1.09□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 UACAQ9BZF9 1416 aa1.09□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 ETDBQ3ZM63 59 aa1.09□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 SPATA8Q6RVD6 105 aa1.09□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.09□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP1.09□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 PSENENQ9NZ42 101 aa1.09□□□□□ -2.23
HERC3-209ENST00000504994 CACNA1CQ13936 2221 aa1.09□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 LAMC1P11047 1609 aa1.08□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 TENM1Q9UKZ4 2725 aa1.08□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 HMGN3Q15651 99 aa1.08□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 ADIRFQ15847 76 aa1.08□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 NMSQ5H8A3 153 aa1.08□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 FDCSPQ8NFU4 85 aa1.08□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 SPCS1Q9Y6A9 102 aa1.08□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa1.08□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 ATP10BO94823 1461 aa1.07□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 NUP188Q5SRE5 1749 aa1.07□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 F8WEM9 126 aa1.07□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 LEPROTL1O95214 131 aa1.07□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 ARMS2P0C7Q2 107 aa1.07□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 WFDC2Q14508 124 aa1.07□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 ALKAL2Q6UX46 152 aa1.07□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 LINC00846Q9NV44 126 aa1.07□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 UNC13BO14795 1591 aa1.07□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 FBN2P35556 2912 aa1.06□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 NRXN1Q9ULB1 1477 aa1.06□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 D6R8Y8 96 aa1.06□□□□□ -2.24
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HERC3-209ENST00000504994 C10orf113Q5VZT2 155 aa1.06□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 MUSTN1Q8IVN3 82 aa1.06□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 ST20Q9HBF5 79 aa1.06□□□□□ -2.24
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HERC3-209ENST00000504994 ABCC3O15438 1527 aa1.05□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 A0A087WVE0 104 aa1.05□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa1.05□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP1.05□□□□□ -2.24
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HERC3-209ENST00000504994 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP1.05□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa1.05□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 ACYP1P07311 99 aa1.04□□□□□ -2.24
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HERC3-209ENST00000504994 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa1.04□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 ERCC6L2Q5T890 1561 aa1.04□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP1.04□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa1.03□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 S100A3P33764 101 aa1.03□□□□□ -2.24
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HERC3-209ENST00000504994 PLAC8Q9NZF1 115 aa1.03□□□□□ -2.24
HERC3-209ENST00000504994 CEP162Q5TB80 1403 aa1.03□□□□□ -2.24
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HERC3-209ENST00000504994 A0A0D9SFI3 127 aa1.01□□□□□ -2.25
HERC3-209ENST00000504994 KCPQ6ZWJ8 1503 aa1□□□□□ -2.25
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HERC3-209ENST00000504994 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa1□□□□□ -2.25
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HERC3-209ENST00000504994 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP0.99□□□□□ -2.25
HERC3-209ENST00000504994 IQSEC2Q5JU85 1478 aa0.99□□□□□ -2.25
HERC3-209ENST00000504994 C1orf167Q5SNV9 1468 aa0.99□□□□□ -2.25
HERC3-209ENST00000504994 KNDC1Q76NI1 1749 aa0.99□□□□□ -2.25
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HERC3-209ENST00000504994 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa0.99□□□□□ -2.25
HERC3-209ENST00000504994 KDM5DQ9BY66 1539 aa0.99□□□□□ -2.25
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