RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498443.5

TSPAN1-209, Transcript of tetraspanin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TSPAN1, Length 1,071 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN1-209ENST00000498443 TIMM17BO60830 172 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 PCP4P48539 62 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 C1orf158Q8N1D5 194 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 MUC4Q99102 2169 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.17□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 A0A0J9YXY3 114 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 H7C423 109 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 IFITM1P13164 125 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 HERVK_113P63121 156 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.16□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 K7EQD1 137 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 APOMO95445 188 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 TSPAN13O95857 204 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 TSPEAR-AS2P59090 65 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 UBE2D3P61077 147 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 UBE2D2P62837 147 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 SPANXDQ9BXN6 97 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 SPANXCQ9NY87 97 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 ERG28Q9UKR5 140 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 CELA1Q9UNI1 258 aa7.15□□□□□ -1.26
TSPAN1-209ENST00000498443 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 H3BMG7 143 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 M0QXV9 152 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 Q8NAQ8 132 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 TMEM101Q96IK0 257 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 NDUFA12Q9UI09 145 aa7.14□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 CFC1BP0CG36 223 aa7.13□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 CFC1P0CG37 223 aa7.13□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 Q6ZSN1 163 aa7.13□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa7.13□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 A4D1N5 150 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 UBE2L6O14933 153 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 COX6CP09669 75 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 PSMB2P49721 201 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa7.12□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 KMT2AQ03164 3969 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 NDUFA1O15239 70 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 HERV-K104P63124 156 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 WFDC2Q14508 124 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 MIAQ16674 131 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 Q6ZUT4 128 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 TMEM243Q9BU79 118 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 PPDPFQ9H3Y8 114 aa7.11□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 IGHV3-33P01772 117 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 SCGB1A1P11684 91 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 Q1RN00 199 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 PRO0461Q9UI25 63 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.1□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa7.09□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.09□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa7.09□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 PRSS2P07478 247 aa7.09□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 ATXN8Q156A1 80 aa7.09□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 SFTA2Q6UW10 78 aa7.09□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 Q6ZTI0 123 aa7.09□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.09□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 FAM104AQ969W3 186 aa7.09□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
TSPAN1-209ENST00000498443 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.08□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 PLAC8L1A1L4L8 177 aa7.08□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.08□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 SPINK8P0C7L1 97 aa7.08□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 ETDBQ3ZM63 59 aa7.08□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.08□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 SIGMAR1Q99720 223 aa7.08□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa7.07□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 GAGE12JA6NER3 117 aa7.07□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 TMEM262E9PQX1 116 aa7.07□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 GAGE4Q13068 117 aa7.07□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 GAGE5Q13069 117 aa7.07□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 Q6ZTC4 211 aa7.07□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 TEN1Q86WV5 123 aa7.07□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.07□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa7.07□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 GAGE7O76087 117 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 TCL1BO95988 128 aa7.06□□□□□ -1.28
TSPAN1-209ENST00000498443 GAGE12FP0CL80 117 aa7.06□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms