RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480472.5

TTLL4-218, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 4, human

TSL 4

Gene TTLL4, Length 765 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL4-218	ENST00000480472	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		4.94	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	EMP1	P54849	157 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	RNF151	Q2KHN1	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	AMELX	Q99217	191 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472		F8W1H4	67 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	HTN1	P15515	57 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	STH	Q8IWL8	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	DEFB104A	Q8WTQ1	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	VPS25	Q9BRG1	176 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472		A0A0J9YXV3	536 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	TMEM238	C9JI98	176 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	COTL1	Q14019	142 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TTLL4-218	ENST00000480472	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	TINCR	A0A1B0GVN0	87 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	TSPAN13	O95857	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	MIF	P14174	115 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472		Q6ZSN1	163 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	TMEM263	Q8WUH6	116 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472		X6R8D5	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472		A0A0B4J2C4	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472		J3QR89	54 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	CIDEA	O60543	219 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	SMR3B	P02814	79 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	AZU1	P20160	251 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	PCP4	P48539	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	UBE2D3	P61077	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	UBE2D2	P62837	147 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	SMAGP	Q0VAQ4	97 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472		Q6ZUT4	128 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	FAM104A	Q969W3	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	PRO0461	Q9UI25	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	TRBV20-1	A0A075B6N2	111 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	IGLV5-45	A0A087WSX0	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	TRGV1	A0A0A0MS02	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472		A0A0J9YXY3	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	TEX48	A0A1B0GUV7	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472		H3BMG7	143 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472		K7EQD1	137 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	APOM	O95445	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	PRM2	P04554	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	C16orf74	Q96GX8	76 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	AGRN	O00468	2067 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472		A4D1N5	150 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	TIMM17B	O60830	172 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	CFC1	P0CG37	223 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	TIRAP	P58753	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	DAZ2	Q13117	558 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	DAZ4	Q86SG3	579 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	GEMIN7	Q9H840	131 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	DAZ3	Q9NR90	486 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	SPANXC	Q9NY87	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	CSDC2	Q9Y534	153 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TTLL4-218	ENST00000480472	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.86	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.6 ms