RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478080.5

CDHR3-211, Transcript of cadherin related family member 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CDHR3, Length 2,633 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR3-211ENST00000478080 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.24□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa6.24□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 A0A096LPF7 62 aa6.24□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 A0A0U1RRA0 63 aa6.24□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 ZFAND6Q6FIF0 208 aa6.24□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 CITED1Q99966 193 aa6.23□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1B0GV72 72 aa6.23□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 SMIM1B2RUZ4 78 aa6.23□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 HERVK_113P63121 156 aa6.23□□□□□ -1.41
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CDHR3-211ENST00000478080 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.22□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 Q9H8V8 135 aa6.22□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 TCL1BO95988 128 aa6.22□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 GYPEP15421 78 aa6.22□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa6.22□□□□□ -1.41
CDHR3-211ENST00000478080 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa6.22□□□□□ -1.41
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CDHR3-211ENST00000478080 LINC00612Q8N6U2 182 aa6.21□□□□□ -1.41
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CDHR3-211ENST00000478080 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.21□□□□□ -1.42
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CDHR3-211ENST00000478080 A0A0B4J2C4 111 aa6.2□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 CARD19Q96LW7 228 aa6.2□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 CDIP1Q9H305 208 aa6.2□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 ERG28Q9UKR5 140 aa6.2□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa6.19□□□□□ -1.42
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CDHR3-211ENST00000478080 Q1RN00 199 aa6.19□□□□□ -1.42
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CDHR3-211ENST00000478080 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.19□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 CELA1Q9UNI1 258 aa6.19□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
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CDHR3-211ENST00000478080 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.18□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 PRIMA1Q86XR5 153 aa6.18□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 TOMM7Q9P0U1 55 aa6.18□□□□□ -1.42
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CDHR3-211ENST00000478080 H7C423 109 aa6.17□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 PAX4O43316 350 aa6.17□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.17□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 TEN1Q86WV5 123 aa6.17□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 Q8N3U1 123 aa6.17□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 TRIAP1O43715 76 aa6.17□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa6.17□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 APOC4P55056 127 aa6.17□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.17□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 MEIG1Q5JSS6 88 aa6.17□□□□□ -1.42
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CDHR3-211ENST00000478080 XGP55808 180 aa6.16□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
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CDHR3-211ENST00000478080 LYRM9A8MSI8 78 aa6.15□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 DAD1P61803 113 aa6.15□□□□□ -1.42
CDHR3-211ENST00000478080 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.15□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.15□□□□□ -1.43
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CDHR3-211ENST00000478080 XCL1P47992 114 aa6.14□□□□□ -1.43
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CDHR3-211ENST00000478080 ICOSQ9Y6W8 199 aa6.14□□□□□ -1.43
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CDHR3-211ENST00000478080 RETNQ9HD89 108 aa6.13□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa6.13□□□□□ -1.43
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CDHR3-211ENST00000478080 RNF183Q96D59 192 aa6.13□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.12□□□□□ -1.43
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CDHR3-211ENST00000478080 MIFP14174 115 aa6.12□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.12□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 SLC25A20O43772 301 aa6.12□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 ATP5G1P05496 136 aa6.12□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 HERV-K104P63124 156 aa6.12□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.12□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 STAB1Q9NY15 2570 aa6.11□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 A0A1B0GUV1 79 aa6.11□□□□□ -1.43
CDHR3-211ENST00000478080 WIPF1O43516 503 aa6.11□□□□□ -1.43
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