RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472230.5

GCFC2-208, Transcript of GC-rich sequence DNA-binding factor 2, human

TSL 2

Gene GCFC2, Length 2,265 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GCFC2-208	ENST00000472230	SPATA25	Q9BR10	227 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A0J9YXY3	114 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	TMEM238	C9JI98	176 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230		K7EIL1	84 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230		Q6ZTC4	211 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		12.67	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	VAMP3	Q15836	100 aa		12.66	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV5-39	A0A0G2JS06	123 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	LELP1	Q5T871	98 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	C9orf118	A6NHY6	69 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	SS18	Q15532	418 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	C11orf45	Q8TAV5	145 aa		12.65	□□□□□ -0.38
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230		H3BNG1	76 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230		K7ERJ3	54 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	MRAP	Q8TCY5	172 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		12.64	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	NDUFA1	O15239	70 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV3-30	P01768	117 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		12.63	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	NANOS2	P60321	138 aa	Known RBP	12.63	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	12.63	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230		H3BUT2	72 aa		12.62	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	CLPSL2	Q6UWE3	100 aa		12.62	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	12.62	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		12.61	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	CCL25	O15444	150 aa		12.6	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230		Q9H8V8	135 aa		12.6	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		12.6	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		12.6	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		12.6	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	NAA38	Q9BRA0	125 aa	Known RBP	12.6	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		12.59	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1B0GWB2	263 aa		12.59	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	12.59	□□□□□ -0.39
GCFC2-208	ENST00000472230	XCL1	P47992	114 aa		12.58	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	RPL24	P83731	157 aa	Known RBP	12.58	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	C5orf38	Q86SI9	138 aa		12.58	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A087WZ39	114 aa		12.58	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	TIMM17B	O60830	172 aa		12.58	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		12.58	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	COX7B2	Q8TF08	81 aa		12.58	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		12.58	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	APOM	O95445	188 aa		12.57	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	PRSS2	P07478	247 aa		12.57	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	REG3A	Q06141	175 aa		12.57	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	UBE2V1	Q13404	147 aa		12.57	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	SPANXD	Q9BXN6	97 aa		12.57	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	SPANXC	Q9NY87	97 aa		12.57	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230		Q8N3U1	123 aa		12.57	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	LITAF	Q99732	161 aa		12.57	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	HERV-K104	P63124	156 aa		12.56	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	12.56	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A1W2PPM0	123 aa		12.55	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	MIA	Q16674	131 aa		12.55	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	MEIG1	Q5JSS6	88 aa		12.55	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLL5	B9A064	214 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	FABP2	P12104	132 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230		A4D1N5	150 aa		12.54	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE10	A6NGK3	116 aa		12.53	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		12.53	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV10	A0A0B4J240	114 aa		12.53	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	GTF2H5	Q6ZYL4	71 aa		12.53	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
GCFC2-208	ENST00000472230	TRAV16	A0A0A6YYK6	109 aa	Predicted RBP	12.52	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		12.52	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	CFC1B	P0CG36	223 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	CFC1	P0CG37	223 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	PGPEP1	Q9NXJ5	209 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	KLK12	Q9UKR0	248 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	IGHV3-33	P01772	117 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	IFITM1	P13164	125 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	NPC2	P61916	151 aa		12.51	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A0U1RRA0	63 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	COX7A2L	O14548	114 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	SPCS1	Q9Y6A9	102 aa		12.5	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	DAND5	Q8N907	189 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230		K7EP34	96 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	CRP	P02741	224 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	ESRG	Q1W209	222 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	C6orf226	Q5I0X4	101 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	COPS9	Q8WXC6	57 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		12.49	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	NOTCH1	P46531	2555 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	ANK2	Q01484	3957 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	MAL	P21145	153 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	SFTA2	Q6UW10	78 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230		A0A0B4J2C4	111 aa		12.48	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	PRR34	Q9NV39	138 aa		12.46	□□□□□ -0.41
GCFC2-208	ENST00000472230	TSPAN13	O95857	204 aa		12.46	□□□□□ -0.42
GCFC2-208	ENST00000472230		Q8IZM0	81 aa		12.46	□□□□□ -0.42
GCFC2-208	ENST00000472230	UBE2W	Q96B02	151 aa		12.45	□□□□□ -0.42
GCFC2-208	ENST00000472230	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		12.45	□□□□□ -0.42

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