RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468600.1

SSB-208, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 2

Gene SSB, Length 290 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-208ENST00000468600 LINC01545Q5VT33 79 aa-2.58□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 HCG22E2RYF7 251 aa-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 GNG3P63215 75 aa-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 PSPHP78330 225 aa-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 C10orf128Q5T292 105 aa-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 FAM24BQ8N5W8 94 aa-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 DYDC1Q8WWB3 177 aa-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 PRDM2Q13029 1718 aa-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 DISP2A7MBM2 1401 aa-2.59□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-2.6□□□□□ -2.82
SSB-208ENST00000468600 TCRAP04437 139 aa-2.6□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 SEC11AP67812 179 aa-2.6□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 PRLHP81277 87 aa-2.6□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 SMIM20Q8N5G0 67 aa-2.6□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 CFAP53Q96M91 514 aa-2.6□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 LENEPQ9Y5L5 61 aa-2.6□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-2.6□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 MYH2Q9UKX2 1941 aa-2.6□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-2.6□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 ALKQ9UM73 1620 aa-2.6□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 IGLC7A0M8Q6 106 aa-2.61□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 AQP10Q96PS8 301 aa-2.61□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-2.62□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 SIX6O95475 246 aa-2.62□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 CCL8P80075 99 aa-2.62□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 FAIMQ9NVQ4 179 aa-2.62□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 CLIP1P30622 1438 aa-2.62□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 SFT2D2O95562 160 aa-2.63□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-2.63□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 CBLN1P23435 193 aa-2.63□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 CLLU1Q5K131 121 aa-2.63□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 WFDC9Q8NEX5 89 aa-2.63□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 PRO1933Q9H354 126 aa-2.63□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa-2.63□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 MED31Q9Y3C7 131 aa-2.63□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-2.63□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 ARHGEF5Q12774 1597 aa-2.63□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 A2MP01023 1474 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 PXDNQ92626 1479 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 SMIM24O75264 130 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 SNCAP37840 140 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 S100A7L2Q5SY68 101 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 TTC9CQ8N5M4 171 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 SEC11CQ9BY50 192 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 COPZ2Q9P299 210 aa-2.64□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-2.65□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 CEP19Q96LK0 163 aa-2.65□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 CALML5Q9NZT1 146 aa-2.65□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-2.66□□□□□ -2.83
SSB-208ENST00000468600 REEP5Q00765 189 aa-2.66□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 NMSQ5H8A3 153 aa-2.66□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-2.66□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 TMED4Q7Z7H5 227 aa-2.66□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 LCN9Q8WX39 176 aa-2.66□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 V9GYQ6 96 aa-2.66□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa-2.67□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 A0A0G2JMZ2 1700 aa-2.67□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 MYH6P13533 1939 aa-2.67□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa-2.67□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 A0A1B0GU69 56 aa-2.67□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 TMEM238C9JI98 176 aa-2.67□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 TAC4Q86UU9 113 aa-2.67□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-2.67□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-2.67□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 DAPK1P53355 1430 aa-2.68□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 E7EQ34 232 aa-2.68□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 SNCGO76070 127 aa-2.68□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 HLA-DRB4P13762 266 aa-2.68□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 TCTAP57738 103 aa-2.68□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-2.68□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 DYNLRB1Q9NP97 96 aa-2.68□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-2.68□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-2.68□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 ARHGEF10O15013 1369 aa-2.69□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 FAM223BA6NKX1 122 aa-2.69□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 IL5P05113 134 aa-2.69□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 IGLC1P0CG04 106 aa-2.69□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 OR8I2Q8N0Y5 310 aa-2.69□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 PP6455Q8WZ26 134 aa-2.69□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 CCDC32Q9BV29 185 aa-2.69□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 PARVGQ9HBI0 331 aa-2.69□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 PSENENQ9NZ42 101 aa-2.69□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-2.7□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-2.7□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 DEFB4AO15263 64 aa-2.7□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 TNP1P09430 55 aa-2.7□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 BTAF1O14981 1849 aa-2.7□□□□□ -2.84
SSB-208ENST00000468600 ERCC6Q03468 1493 aa-2.71□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms