RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 VCX2Q9H322 139 aa8.31□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 PSCAO43653 123 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 PRSS1P07477 247 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 AMELXQ99217 191 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 C2orf88Q9BSF0 95 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 KLK12Q9UKR0 248 aa8.3□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 H0Y8G0 127 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 KRTDAPP60985 99 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 PMVKQ15126 192 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 C10orf126Q8N4M7 172 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 Q9HAA7 133 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 MYCBP2O75592 4640 aa8.29□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 K7EP13 123 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 CRPP02741 224 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 C3orf79P0CE67 100 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 REG3AQ06141 175 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 OR10D4PQ8NGN7 298 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 CST9LQ9H4G1 147 aa8.28□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.08
PRAME-208ENST00000438888 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 UBE2WQ96B02 151 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 PRR34Q9NV39 138 aa8.27□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 PET117Q6UWS5 81 aa8.26□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 FAM229AH3BQW9 127 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 UBE2D1P51668 147 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 ODF1Q14990 250 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 MIAQ16674 131 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 ENHOQ6UWT2 76 aa8.25□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP8.25□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 C20orf202A1L168 122 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 F8VRH5 84 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 CCL25O15444 150 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 SS18Q15532 418 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 LINC01545Q5VT33 79 aa8.24□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 A0A0J9YXV3 536 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 SEC11AP67812 179 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 Q8N814 137 aa8.23□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 IGLC3P0DOY3 106 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 AKR1D1P51857 326 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 LINC00242Q5T6M2 205 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 PMCHL2Q9BQD1 86 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.22□□□□□ -1.09
PRAME-208ENST00000438888 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 J3QL48 77 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 DPM2O94777 84 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 PLNP26678 52 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 XCL1P47992 114 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 RMI2Q96E14 147 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 C1orf43Q9BWL3 253 aa8.21□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 C11orf86A6NJI1 115 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 LECT2O14960 151 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 SCGB1D1O95968 90 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 HERVK_113P63121 156 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 CD164L2Q6UWJ8 174 aa8.2□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 IGKCP01834 107 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 COX6A2Q02221 97 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 WFDC2Q14508 124 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 FOXI1Q12951 378 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 COX11Q9Y6N1 276 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 TM2D2Q9BX73 214 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 H3BRM9 83 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 COX7A2LO14548 114 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 PYY3Q5JQD4 70 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 C5orf38Q86SI9 138 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-208ENST00000438888 ATOH7Q8N100 152 aa8.16□□□□□ -1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 176.1 ms