RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 GYPEP15421 78 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-202ENST00000435136 COX6A2Q02221 97 aa13.05□□□□□ -0.32
SH3BP2-202ENST00000435136 A8MZ25 164 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-202ENST00000435136 G3V4G9 280 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-202ENST00000435136 OXLD1Q5BKU9 147 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-202ENST00000435136 LITAFQ99732 161 aa13.04□□□□□ -0.32
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-202ENST00000435136 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa13.03□□□□□ -0.32
SH3BP2-202ENST00000435136 GAGE6Q13070 117 aa13.02□□□□□ -0.32
SH3BP2-202ENST00000435136 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.02□□□□□ -0.32
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 SMIM1B2RUZ4 78 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 DAD1P61803 113 aa13.02□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A0B4J2C4 111 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 F5H768 121 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 PAX4O43316 350 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A1B0GUV1 79 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 SPART-AS1P0CW21 52 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa13.01□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP5G1P05496 136 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 CFC1BP0CG36 223 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 CFC1P0CG37 223 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 LYRM7Q5U5X0 104 aa13□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 IFITM1P13164 125 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 MIAQ16674 131 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 MUSTN1Q8IVN3 82 aa12.99□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 A4D1N5 150 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 APOMO95445 188 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 PRO1854Q9UHT4 67 aa12.98□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 TSPAN13O95857 204 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 HERV-K104P63124 156 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 SH2D6Q7Z4S9 175 aa12.97□□□□□ -0.33
SH3BP2-202ENST00000435136 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.96□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 COPS9Q8WXC6 57 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 CELA1Q9UNI1 258 aa12.95□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 Q9H8V8 135 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 DEFB4AO15263 64 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 KRTAP10-11P60412 298 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa12.94□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC01561Q8N1V8 128 aa12.93□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 F8W1H4 67 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 RBX1P62877 108 aa12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A087WZ39 114 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 SFTA2Q6UW10 78 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 IGHV3-33P01772 117 aa12.91□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 PRSS2P07478 247 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 ERG28Q9UKR5 140 aa12.9□□□□□ -0.34
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 SS18Q15532 418 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 COX7B2Q8TF08 81 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 DNAH3Q8TD57 4116 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 TMEM262E9PQX1 116 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 OCIAD2Q56VL3 154 aa12.89□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP12.88□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 H3BNG1 76 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 ARL17AQ8IVW1 177 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 H3BMG7 143 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 K7ERU9 68 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 LELP1Q5T871 98 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00308Q8TCZ7 52 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 A0A096LPF7 62 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 MEIG1Q5JSS6 88 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 PRO0461Q9UI25 63 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP2-202ENST00000435136 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TGP01266 2768 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 PSMB2P49721 201 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 HTN3P15516 51 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 CD164L2Q6UWJ8 174 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 SCGB1C2P0DMR2 95 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 Q8IZM0 81 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 K7EIL1 84 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TCL1BO95988 128 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 Q1RN00 199 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 C5orf38Q86SI9 138 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 DAND5Q8N907 189 aa12.79□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 NPC2P61916 151 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 XCL1P47992 114 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 REG3AQ06141 175 aa12.78□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 WFDC2Q14508 124 aa12.77□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 RETNQ9HD89 108 aa12.77□□□□□ -0.36
SH3BP2-202ENST00000435136 ANGP03950 147 aaKnown RBP12.77□□□□□ -0.37
SH3BP2-202ENST00000435136 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa12.77□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.7 ms