RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429899.1

ATG4B-211, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 4

Gene ATG4B, Length 524 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-211ENST00000429899 LINC01545Q5VT33 79 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa6.71□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 UBE2L6O14933 153 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 ODF1Q14990 250 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 MPV17L2Q567V2 206 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 PET117Q6UWS5 81 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 AMELXQ99217 191 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
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ATG4B-211ENST00000429899 SMAGPQ0VAQ4 97 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 Q6ZN92 141 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 Q8N3U1 123 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 A0A087WX48 190 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 A0A1B0GUV1 79 aa6.68□□□□□ -1.34
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ATG4B-211ENST00000429899 RBX1P62877 108 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 PMVKQ15126 192 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 OR5A1Q8NGJ0 315 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 CST9LQ9H4G1 147 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 C20orf202A1L168 122 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 F8VRH5 84 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 PRSS1P07477 247 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 MT1HL1P0DM35 61 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 TEX43Q6ZNM6 134 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 PMCHL2Q9BQD1 86 aa6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 SIVA1O15304 175 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 UBE2D1P51668 147 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF664Q8N3J9 261 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM101Q96IK0 257 aa6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 SCGB1D1O95968 90 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 IGLC3P0DOY3 106 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 NFE4Q86UQ8 179 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 VCX2Q9H322 139 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-211ENST00000429899 C11orf86A6NJI1 115 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM262E9PQX1 116 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 DPM2O94777 84 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 PLNP26678 52 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 Q6ZSA8 131 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 PRR34Q9NV39 138 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 MUC2Q02817 5179 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 A0A0J9YXV3 536 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 IGKCP01834 107 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 ATOH7Q8N100 152 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 CHAC1Q9BUX1 264 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 IGHV3-30P01768 117 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 IGHV3-33P01772 117 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 ANGP03950 147 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00242Q5T6M2 205 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00269Q8N2A0 174 aa6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa6.61□□□□□ -1.35
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ATG4B-211ENST00000429899 REG3AQ06141 175 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 MAJINQ3KP22 176 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 C12orf57Q99622 126 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 KLK12Q9UKR0 248 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 TRAV9-2A0A087WT02 112 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 hDV102S1A0JD36 115 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 ENHOQ6UWT2 76 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 SCXQ7RTU7 201 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 CCL25O15444 150 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 HERVK_113P63121 156 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 SEC11AP67812 179 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 COX6A2Q02221 97 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 VAMP8Q9BV40 100 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-211ENST00000429899 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-211ENST00000429899 TMEM223A0PJW6 202 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-211ENST00000429899 CRPP02741 224 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-211ENST00000429899 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-211ENST00000429899 STPG4Q8N801 248 aa6.58□□□□□ -1.36
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