RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429581.2

PTPRD-AS2-201, Transcript of PTPRD antisense RNA 2 (head to head), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD-AS2, Length 2,838 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMIM1B2RUZ4 78 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.89□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TCL1BO95988 128 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLPSL2Q6UWE3 100 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NOTCH1P46531 2555 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CITED1Q99966 193 aa8.88□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 INSL3P51460 131 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TOMM7Q9P0U1 55 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRO0461Q9UI25 63 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.87□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TMEM262E9PQX1 116 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV3-33P01772 117 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ERG28Q9UKR5 140 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 F8W1H4 67 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CELA1Q9UNI1 258 aa8.86□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 F5H768 121 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HTN3P15516 51 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MIAQ16674 131 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRIMA1Q86XR5 153 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 G3V4G9 280 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NDUFA1O15239 70 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 OXLD1Q5BKU9 147 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q8N3U1 123 aa8.85□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MEIG1Q5JSS6 88 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C5orf38Q86SI9 138 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COL6A5A8TX70 2615 aa8.84□□□□□ -0.99
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANK2Q01484 3957 aa8.84□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A0B4J2C4 111 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPANXDQ9BXN6 97 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPANXCQ9NY87 97 aa8.83□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TENM3Q9P273 2699 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PAX4O43316 350 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PCP4P48539 62 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PRO0255Q9UI72 69 aa8.82□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRIAP1O43715 76 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CIDEAO60543 219 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 XCL1P47992 114 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 APOC4P55056 127 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 DAD1P61803 113 aa8.81□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMIM9A6NGZ8 99 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SMAGPQ0VAQ4 97 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.8□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RETNQ9HD89 108 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C9JAW5 83 aa8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.79□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 Q8NAQ8 132 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 H7C423 109 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CLEC2BQ92478 149 aa8.78□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LYRM9A8MSI8 78 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 COX7B2Q8TF08 81 aa8.77□□□□□ -1
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 WFDC9Q8NEX5 89 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ICOSQ9Y6W8 199 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TIMM17BO60830 172 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 PFN2P35080 140 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00269Q8N2A0 174 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 KRTAP10-11P60412 298 aa8.76□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SLC25A20O43772 301 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ATP5G1P05496 136 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 IFITM1P13164 125 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANGP03950 147 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC00158P58513 81 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C2orf82Q6UX34 121 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 RNF183Q96D59 192 aa8.74□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 FOXI1Q12951 378 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 A0A087WZ39 114 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SPART-AS1P0CW21 52 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 MIFP14174 115 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 CARD19Q96LW7 228 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 LINC01620Q4KN68 170 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 C6orf226Q5I0X4 101 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 HERV-K104P63124 156 aa8.72□□□□□ -1.01
PTPRD-AS2-201ENST00000429581 SS18Q15532 418 aa8.72□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms