RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 J3QR89 54 aa13.14□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRSS2P07478 247 aa13.14□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIAQ16674 131 aa13.14□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIMM17BO60830 172 aa13.14□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAGE6Q13070 117 aa13.14□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.13□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F5H768 121 aa13.13□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV3-33P01772 117 aa13.13□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCL1BO95988 128 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEFB135Q30KP9 77 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa13.12□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q9H8V8 135 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATRQ13535 2644 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOC4P55056 127 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM222AQ5U5X8 452 aa13.11□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GYPEP15421 78 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ERG28Q9UKR5 140 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa13.1□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LYRM9A8MSI8 78 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NPC2P61916 151 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRO0255Q9UI72 69 aa13.09□□□□□ -0.31
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCGB1C2P0DMR2 95 aa13.08□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WFDC9Q8NEX5 89 aa13.08□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 H7C2G1 150 aa13.08□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DAND5Q8N907 189 aa13.08□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IFITM1P13164 125 aa13.07□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RNF183Q96D59 192 aa13.07□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DEFB4AO15263 64 aa13.06□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GAGE12HA6NDE8 117 aa13.06□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FOXI1Q12951 378 aa13.06□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA25Q9BR10 227 aa13.06□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa13.05□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.05□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WIPF1O43516 503 aa13.05□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q1RN00 199 aa13.05□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRIMA1Q86XR5 153 aa13.05□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PAX4O43316 350 aa13.03□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SIGMAR1Q99720 223 aa13.03□□□□□ -0.32
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HERV-K104P63124 156 aa13.02□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TEN1Q86WV5 123 aa13.02□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q8NAQ8 132 aa13.02□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00308Q8TCZ7 52 aa13.02□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa13.01□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A096LPF7 62 aa13.01□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa13.01□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A0U1RRA0 63 aa13.01□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIFP14174 115 aa13.01□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPDPFLQ8WWR9 84 aa13.01□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa13□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 M0QXV9 152 aa13□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa13□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DAD1P61803 113 aa13□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MEIG1Q5JSS6 88 aa13□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CARD19Q96LW7 228 aa13□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIAP1O43715 76 aa13□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COX7B2Q8TF08 81 aa13□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CELA1Q9UNI1 258 aa13□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A1B0GUV1 79 aa12.99□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa12.98□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM262E9PQX1 116 aa12.98□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATXN8Q156A1 80 aa12.98□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa12.98□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ICOSQ9Y6W8 199 aa12.98□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F8P00451 2351 aa12.98□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 A0A087WZ39 114 aa12.97□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C9JAW5 83 aa12.97□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SLC25A20O43772 301 aa12.97□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.97□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COPS9Q8WXC6 57 aa12.97□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TOMM7Q9P0U1 55 aa12.97□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ATP5G1P05496 136 aa12.96□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SCGB1A1P11684 91 aa12.96□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C5orf38Q86SI9 138 aa12.95□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPART-AS1P0CW21 52 aa12.94□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC01620Q4KN68 170 aa12.94□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC01600Q96MT4 127 aa12.94□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa12.93□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CDIP1Q9H305 208 aa12.93□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SS18Q15532 418 aa12.92□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PPDPFQ9H3Y8 114 aa12.92□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 COX6CP09669 75 aa12.92□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XCL1P47992 114 aa12.92□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OXLD1Q5BKU9 147 aa12.92□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLPSL2Q6UWE3 100 aa12.92□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa12.9□□□□□ -0.34
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa12.89□□□□□ -0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HTN3P15516 51 aa12.89□□□□□ -0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa12.89□□□□□ -0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRTAP10-11P60412 298 aa12.88□□□□□ -0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 LINC00269Q8N2A0 174 aa12.88□□□□□ -0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 Q8N3U1 123 aa12.87□□□□□ -0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.87□□□□□ -0.35
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CLEC2BQ92478 149 aa12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.6 ms