RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425868.5

BBX-208, Transcript of BBX, HMG-box containing, humanhuman

TSL 4

Gene BBX, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBX-208ENST00000425868 PRB1P04280 392 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 ATP5G1P05496 136 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 P0DMU3 169 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 FAM231AP0DMU4 169 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 FAM231CP0DMU5 169 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 COL8A2P25067 703 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 INSL3P51460 131 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 EFNA4P52798 201 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 EMP1P54849 157 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 TMEM170BQ5T4T1 132 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 NDUFA11Q86Y39 141 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 PTH2Q96A98 100 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 PLEKHB2Q96CS7 222 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 TMEM141Q96I45 108 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 HHLA3Q9XRX5 114 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 DNAJC13O75165 2243 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 C2CD3Q4AC94 2353 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 TRAV21A0A0B4J279 112 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 C11orf86A6NJI1 115 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 E7EUB6 86 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 H3BQ85 93 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 M0R2P5 195 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 KRTAP5-9P26371 169 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 CRIP1P50238 77 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 CCL8P80075 99 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 SFTA2Q6UW10 78 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 SBSPONQ8IVN8 264 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 COPS9Q8WXC6 57 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 KAAG1Q9UBP8 84 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.09□□□□□ -1.91
BBX-208ENST00000425868 ITPR1Q14643 2758 aa3.09□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.09□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 CEP295Q9C0D2 2601 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 KNL1Q8NG31 2342 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 SPTA1P02549 2419 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 SDHAF1A6NFY7 115 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 A8MWP4 228 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 OOSP1A8MZH6 123 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 J3KT08 172 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 ACYP1P07311 99 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 RHOHQ15669 191 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 SPRNQ5BIV9 151 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 C9orf153Q5TBE3 101 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 C15orf53Q8NAA6 179 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 FBN2P35556 2912 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 IGF2RP11717 2491 aa3.08□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 POLQO75417 2590 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 CHD7Q9P2D1 2997 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 PCNX2A6NKB5 2137 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 A0A0J9YY99 117 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 CCDC179H3BU77 68 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 H7C2G1 150 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 J3QQQ9 107 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 OVOL1O14753 267 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 LEPROTO15243 131 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 IGHV1-69P01742 117 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 IGHV3-53P01767 116 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 IGHV3-30P01768 117 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 CD7P09564 240 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 COX6B1P14854 86 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 C2orf82Q6UX34 121 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 Q6ZQT7 251 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 OR13C6PQ8NH95 151 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 VPS13AQ96RL7 3174 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 TNCP24821 2201 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa3.07□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 A0A0J9YX75 114 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 SMIM9A6NGZ8 99 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 M0R1W7 72 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 INAFM2P0DMQ5 153 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 BSPH1Q075Z2 132 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 ZNF56Q15929 161 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 MEIG1Q5JSS6 88 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 C3orf22Q8N5N4 141 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 ZNRF2Q8NHG8 242 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 CREBBPQ92793 2442 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 DNAJC30Q96LL9 226 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 CARD19Q96LW7 228 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 TIMM21Q9BVV7 248 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 IMUPQ9GZP8 106 aa3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
BBX-208ENST00000425868 CACNA1DQ01668 2161 aa3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 63.8 ms