RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01600Q96MT4 127 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 LST1O00453 97 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 CRLF1O75462 422 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00308Q8TCZ7 52 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 CITED1Q99966 193 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-202ENST00000417536 K7EQD1 137 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SNCGO76070 127 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE12JA6NER3 117 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE4Q13068 117 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE5Q13069 117 aa13.33□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV4A0A0B4J268 109 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 IL17DQ8TAD2 202 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SMIM1B2RUZ4 78 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BT86 120 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 HILS1P60008 231 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 CCL24O00175 119 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 CLUHP3Q96NS8 147 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 ANAPC13Q9BS18 74 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 PRIMA1Q86XR5 153 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 MEIG1Q5JSS6 88 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE2BQ13066 116 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE2EQ4V326 116 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE2DQ9UEU5 116 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 STAB1Q9NY15 2570 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 TRAV25A0A0B4J276 109 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP10-3P60369 221 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 C15orf53Q8NAA6 179 aa13.27□□□□□ -0.28
SH3BP1-202ENST00000417536 WFDC10AQ9H1F0 79 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 MAST4O15021 2626 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 F5H768 121 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 UBE2L6O14933 153 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 SPATA3Q8NHX4 192 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE7O76087 117 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE12FP0CL80 117 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE12GP0CL81 117 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE12IP0CL82 117 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TTC32Q5I0X7 151 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TRGV2A0A075B6R0 118 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 TMEM243Q9BU79 118 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 COX7A2LO14548 114 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL35AP18077 110 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa13.22□□□□□ -0.29
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SH3BP1-202ENST00000417536 COPS9Q8WXC6 57 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 SHISA2Q6UWI4 295 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 PLAC8L1A1L4L8 177 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 HERV-K104P63124 156 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 DEFB121Q5J5C9 76 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf95Q9H693 158 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 CYSRT1A8MQ03 144 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 GAGE6Q13070 117 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 TOMM7Q9P0U1 55 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 C16orf74Q96GX8 76 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 Q6Q795 121 aa13.16□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP1-202ENST00000417536 COX7B2Q8TF08 81 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM218AQ96MZ4 157 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 COL6A5A8TX70 2615 aa13.13□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 B5MCH6 92 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 PF4P02776 101 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 BAALC-AS2P0C853 105 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CHCHD5Q9BSY4 110 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 C19orf73Q9NVV2 129 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TRACP01848 142 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CRPP02741 224 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00158P58513 81 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC00337Q8N6G1 96 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC179H3BU77 68 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 OVOL2Q9BRP0 275 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 Q9HAA7 133 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 SS18L2Q9UHA2 77 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-202ENST00000417536 IGLV1-51P01701 117 aa13.09□□□□□ -0.31
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