RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416453.6

GTF3C2-AS1-201, GTF3C2 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GTF3C2-AS1, Length 863 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 K7ERU9 68 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SMIM13P0DJ93 91 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LELP1Q5T871 98 aa6.95□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 F8VRH5 84 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 H7C1H1 209 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GCSHP23434 173 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PCP4P48539 62 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBE2D3P61077 147 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBE2D2P62837 147 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RNF151Q2KHN1 245 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 XP32Q5T750 250 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TOMM6Q96B49 74 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SCGB3A1Q96QR1 104 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.94□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC01549A6NIU2 74 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGHV3-30P01768 117 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGHV3-33P01772 117 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FABP2P12104 132 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FXYD2P54710 66 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CEND1Q8N111 149 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TM2D2Q9BX73 214 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.93□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RAB37Q96AX2 223 aa6.92□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VPS25Q9BRG1 176 aa6.92□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 M0QY20 66 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C10orf126Q8N4M7 172 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.91□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C2orf66Q6UXQ4 117 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 Q9HAA7 133 aa6.9□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.89□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa6.89□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 E9PLD3 99 aa6.89□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa6.89□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NFE4Q86UQ8 179 aa6.89□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.89□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 BAALCQ8WXS3 180 aa6.89□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CYSLTR1Q9Y271 337 aa6.89□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 K7ERJ3 54 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HERVK_113P61574 105 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 COTL1Q14019 142 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMEM141Q96I45 108 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HIST1H4GQ99525 98 aa6.88□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A1B0GWB2 263 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 DNAJC30Q96LL9 226 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.87□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 VCYO14598 125 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KRTAP10-2P60368 255 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TIMM17AQ99595 171 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHCHD5Q9BSY4 110 aa6.86□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 HERC2O95714 4834 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C16orf90A8MZG2 172 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TMEM262E9PQX1 116 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PSCAO43653 123 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.85□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 GAGE6Q13070 117 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 PMVKQ15126 192 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KIR2DL4Q99706 377 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 KLK12Q9UKR0 248 aa6.85□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 A0A087WTM6 91 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 ZNF815PA8K554 130 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CHCHD7Q9BUK0 85 aa6.84□□□□□ -1.31
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa6.83□□□□□ -1.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa6.83□□□□□ -1.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 IGIPA6NJ69 53 aa6.83□□□□□ -1.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 C11orf86A6NJI1 115 aa6.83□□□□□ -1.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 CLPSL2Q6UWE3 100 aa6.83□□□□□ -1.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 UBE2WQ96B02 151 aa6.83□□□□□ -1.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.82□□□□□ -1.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.82□□□□□ -1.32
GTF3C2-AS1-201ENST00000416453 F8W1H4 67 aa6.82□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms