RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411398.1

RNU6-1052P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1052, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1052P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CSN2P05814 226 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NEFHP12036 1026 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1052P-201ENST00000411398 GNG5P63218 68 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSPHP78330 225 aa-2.47□□□□□ -2.8
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MYOM1P52179 1685 aa-2.47□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C4AP0C0L4 1744 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C4BP0C0L5 1744 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CETN3O15182 167 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCL8P80075 99 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LINC01545Q5VT33 79 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C10orf113Q5VZT2 155 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LINC01600Q96MT4 127 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CBLN4Q9NTU7 201 aa-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-2.48□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PSME4Q14997 1843 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPEGQ15772 3267 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NLRP1Q9C000 1473 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MGPP08493 103 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPA17Q15506 151 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-2.49□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CLIP1P30622 1438 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLB1Q6P1J6 1458 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ATG12O94817 140 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 S100A11P31949 105 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCDC42Q96M95 316 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ARMC1Q9NVT9 282 aa-2.5□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 NIPSNAP2O75323 286 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TPM2P07951 284 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TPM1P09493 284 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LTC4SQ16873 150 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C9orf16Q9BUW7 83 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 COPZ2Q9P299 210 aa-2.51□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAM107AO95990 144 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 V9GYQ6 96 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MBD5Q9P267 1494 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAPKBP1O60336 1514 aa-2.52□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM238C9JI98 176 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 M0QZK8 103 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SIX6O95475 246 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TCRAP04437 139 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CBLN1P23435 193 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRO1933Q9H354 126 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAGI2Q86UL8 1455 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IFT140Q96RY7 1462 aa-2.53□□□□□ -2.81
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CEBPGP53567 150 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRLHP81277 87 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FDCSPQ8NFU4 85 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 AQP10Q96PS8 301 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa-2.54□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 IGLC7A0M8Q6 106 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 UBE2G1P62253 170 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 ERCC6Q03468 1493 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 C5orf38Q86SI9 138 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 OR13C6PQ8NH95 151 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PREX1Q8TCU6 1659 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FYCO1Q9BQS8 1478 aa-2.55□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM2Q9UHN6 1383 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SMIM24O75264 130 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SFT2D2O95562 160 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HLA-DRB4P13762 266 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 FAIMQ9NVQ4 179 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 MED31Q9Y3C7 131 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-2.56□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 PFDN1O60925 122 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 SEC11AP67812 179 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 CCL7P80098 99 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TMEM78Q5T7P6 136 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 RGPD5Q99666 1765 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 TET3O43151 1660 aa-2.57□□□□□ -2.82
RNU6-1052P-201ENST00000411398 KIF20BQ96Q89 1820 aa-2.58□□□□□ -2.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.4 ms