RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391058.1

RNU6-1177P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1177, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1177P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ZFYVE9O95405 1425 aa-2.66□□□□□ -2.83
RNU6-1177P-201ENST00000391058 A6NIN4 97 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 H7BZZ5 65 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CST2P09228 141 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPL7P18124 248 aaKnown RBP-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPTSSBQ8NFR3 76 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCDC42Q96M95 316 aa-2.66□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MYH13Q9UKX3 1938 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RBP4P02753 201 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 B2MP61769 119 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCL8P80075 99 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TMED4Q7Z7H5 227 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FDCSPQ8NFU4 85 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LSM6P62312 80 aaKnown RBP-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PSPHP78330 225 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 GINS3Q9BRX5 216 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARMC1Q9NVT9 282 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SS18L2Q9UHA2 77 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ERCC6Q03468 1493 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CEP350Q5VT06 3117 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGLC7A0M8Q6 106 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HSBP1L1C9JCN9 74 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 Q6ZUT4 128 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DAPK1P53355 1430 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RGPD2P0DJD1 1756 aa-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ANKRD36A6QL64 1941 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 RPP14O95059 124 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SIX6O95475 246 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TPM1P09493 284 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRLHP81277 87 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CLLU1Q5K131 121 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ATG12O94817 140 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MGPP08493 103 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CBLN1P23435 193 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C10orf128Q5T292 105 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LCN9Q8WX39 176 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C1orf167Q5SNV9 1468 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MBD5Q9P267 1494 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HLA-DRB4P13762 266 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 UBA52P62987 128 aaKnown RBP-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DYDC1Q8WWB3 177 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LINC00846Q9NV44 126 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MED31Q9Y3C7 131 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARHGEF10O15013 1369 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HCG22E2RYF7 251 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 E7EQ34 232 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SFT2D2O95562 160 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SPA17Q15506 151 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ABCC10Q5T3U5 1492 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C4AP0C0L4 1744 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 C4BP0C0L5 1744 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CLIP1P30622 1438 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PSME4Q14997 1843 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TPM2P07951 284 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TNP1P09430 55 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SEC11AP67812 179 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 S100A7L2Q5SY68 101 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 AQP10Q96PS8 301 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 LRRC37AA6NMS7 1700 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 ARAP2Q8WZ64 1704 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM223BA6NKX1 122 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 MIC13Q5XKP0 118 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TTC9CQ8N5M4 171 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 FAM24BQ8N5W8 94 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 OR13C6PQ8NH95 151 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRAP1Q96NZ9 151 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa-2.76□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMIM23A6NLE4 172 aa-2.76□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 NIPSNAP2O75323 286 aa-2.76□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SEC11CQ9BY50 192 aa-2.76□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP-2.76□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-2.76□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IFT140Q96RY7 1462 aa-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 HMGN4O00479 90 aa-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 SMIM24O75264 130 aa-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 IGLC1P0CG04 106 aa-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 CCL7P80098 99 aa-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PP6455Q8WZ26 134 aa-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 PRO1933Q9H354 126 aa-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-1177P-201ENST00000391058 BANF2Q9H503 90 aa-2.77□□□□□ -2.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms