RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332175.12

PTPRM-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 6,095 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 TIMM17BO60830 172 aa16.26■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP16.26■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP16.25■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 FAM30AQ9NZY2 134 aa16.25■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 POM121L12Q8N7R1 296 aa16.24■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 K7ERS5 55 aa16.23■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 ODF3L2Q3SX64 289 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 COX17Q14061 63 aa16.22■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 M0QXV9 152 aa16.21■□□□□ 0.19
PTPRM-201ENST00000332175 YPEL4Q96NS1 127 aa16.21■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 Q8IZM0 81 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00474Q9P2X8 69 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 SPG11Q96JI7 2443 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 WNK1Q9H4A3 2382 aa16.2■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 C2orf91Q6ZV80 131 aa16.19■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 LST1O00453 97 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 PRR15LQ9BU68 103 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 CUL9Q8IWT3 2517 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa16.18■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 C10orf25Q5T742 122 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 CSPG4Q6UVK1 2322 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 NUPR2A6NF83 97 aa16.17■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 A0A0U1RQV1 116 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 COX6A2Q02221 97 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 C6orf223Q8N319 242 aa16.16■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 PTPN13Q12923 2485 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa16.15■□□□□ 0.18
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZTC4 211 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa16.14■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 PRR3P79522 188 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00242Q5T6M2 205 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 NOTCH2Q04721 2471 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 Q8N9L7 120 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 RETNLBQ9BQ08 111 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 IGIPA6NJ69 53 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 HCFC1P51610 2035 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 IGLV1-51P01701 117 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 REG3GQ6UW15 175 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 CELA1Q9UNI1 258 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 LINC00694P0DN24 101 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 SERP1Q9Y6X1 66 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 TTC28Q96AY4 2481 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 CHCHD7Q9BUK0 85 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 ACACBO00763 2458 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRM-201ENST00000332175 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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PTPRM-201ENST00000332175 SERP2Q8N6R1 65 aa16.07■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 A0A1W2PPR1 153 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 SMIM1B2RUZ4 78 aa16.06■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZVQ6 151 aa16.05■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 PLXNB1O43157 2135 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa16.04■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 LINC01556Q5JQF7 62 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 CNFNQ9BYD5 112 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 A6NED7 52 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa16.03■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 A0A087WYN8 130 aa16.02■□□□□ 0.16
PTPRM-201ENST00000332175 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa16.02■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 C1orf137Q5JT78 98 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 Q8N814 137 aa16.01■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 Q6ZSN1 163 aa16.01■□□□□ 0.15
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PTPRM-201ENST00000332175 C16orf95Q9H693 158 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 TSPEAR-AS2P59090 65 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 CCDC179H3BU77 68 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 NDUFC1O43677 76 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 ZNF580Q9UK33 172 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 V9GYY9 64 aa15.99■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 MUC7Q8TAX7 377 aa15.97■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 XGP55808 180 aa15.96■□□□□ 0.15
PTPRM-201ENST00000332175 PTPRSQ13332 1948 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 X6R8D5 127 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 Q6JHZ5 121 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 Q9BRP9 147 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 IMUPQ9GZP8 106 aa15.94■□□□□ 0.14
PTPRM-201ENST00000332175 EXPH5Q8NEV8 1989 aa15.94■□□□□ 0.14
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