RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293922.1

PTX4-201, Transcript of pentraxin 4, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX4, Length 1,422 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX4-201ENST00000293922 UBE2WQ96B02 151 aa12.18□□□□□ -0.46
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PTX4-201ENST00000293922 MIAQ16674 131 aa12.17□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa12.16□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa12.16□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 CCL25O15444 150 aa12.16□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 CDK2AP2O75956 126 aa12.16□□□□□ -0.46
PTX4-201ENST00000293922 ODF1Q14990 250 aa12.16□□□□□ -0.46
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PTX4-201ENST00000293922 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa12.15□□□□□ -0.46
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PTX4-201ENST00000293922 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP12.13□□□□□ -0.47
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PTX4-201ENST00000293922 DNAH8Q96JB1 4490 aa12.04□□□□□ -0.48
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PTX4-201ENST00000293922 C5orf38Q86SI9 138 aa12.03□□□□□ -0.48
PTX4-201ENST00000293922 LINC01561Q8N1V8 128 aa12.03□□□□□ -0.48
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PTX4-201ENST00000293922 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa11.95□□□□□ -0.5
PTX4-201ENST00000293922 APOMO95445 188 aa11.95□□□□□ -0.5
PTX4-201ENST00000293922 STPG4Q8N801 248 aa11.95□□□□□ -0.5
PTX4-201ENST00000293922 HERVK_113P61574 105 aa11.94□□□□□ -0.5
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PTX4-201ENST00000293922 USP17L23D6RBM5 183 aa11.93□□□□□ -0.5
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