RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261799.8

PDGFRB-201, Transcript of platelet derived growth factor receptor beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDGFRB, Length 5,717 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRB-201ENST00000261799 PCNX3Q9H6A9 2034 aa9.75□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 LIMD2Q9BT23 127 aa9.75□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 SPTSSBQ8NFR3 76 aa9.74□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.73□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 C11orf21Q9P2W6 132 aa9.73□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 MED12LQ86YW9 2145 aa9.73□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 C3orf84H3BNL1 204 aa9.73□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 CUL9Q8IWT3 2517 aa9.73□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 C2orf48Q96LS8 159 aa9.72□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 LST1O00453 97 aa9.72□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 NRACQ8N912 160 aa9.71□□□□□ -0.85
PDGFRB-201ENST00000261799 PRR15LQ9BU68 103 aa9.71□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6ZQY7 126 aa9.71□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa9.7□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa9.7□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 SCXQ7RTU7 201 aa9.7□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 NACAE9PAV3 2078 aa9.7□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 J3QL48 77 aa9.7□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.7□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP9.7□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 C16orf90A8MZG2 172 aa9.69□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP9.69□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.69□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.69□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 COX6A2Q02221 97 aa9.69□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 COL4A2P08572 1712 aa9.69□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 A8MZ25 164 aa9.69□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6JHZ5 121 aa9.68□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6ZVQ6 151 aa9.68□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 XGP55808 180 aa9.68□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 SBSPONQ8IVN8 264 aa9.68□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 PTH2Q96A98 100 aa9.67□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 PRYO14603 147 aa9.67□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 SERP1Q9Y6X1 66 aa9.67□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 NDUFC2-KCTD14E9PQ53 114 aa9.66□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 WFDC13Q8IUB5 93 aa9.66□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 CELA1Q9UNI1 258 aa9.66□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00643Q86TS7 51 aa9.65□□□□□ -0.86
PDGFRB-201ENST00000261799 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.65□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 SMIM11BQ8TCY0 68 aa9.65□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 CACNA1AO00555 2505 aa9.64□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 MED13LQ71F56 2210 aa9.64□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 Q9BRP9 147 aa9.64□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.64□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 A0A1B0GUV1 79 aa9.64□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.64□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 PIEZO1Q92508 2521 aa9.63□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 SPATA3Q8NHX4 192 aa9.63□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP9.63□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 ATRXP46100 2492 aa9.62□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 ENHOQ6UWT2 76 aa9.62□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 TRIAP1O43715 76 aa9.62□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 ESRGQ1W209 222 aa9.62□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC01561Q8N1V8 128 aa9.62□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00242Q5T6M2 205 aa9.62□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa9.61□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 WFDC2Q14508 124 aa9.61□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.6□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 TAX1BP3O14907 124 aa9.6□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 Q8N9L7 120 aa9.6□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 H3BNG1 76 aa9.6□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 RTL8CO15255 209 aa9.59□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa9.59□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 CNFNQ9BYD5 112 aa9.59□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 PTPN13Q12923 2485 aa9.59□□□□□ -0.87
PDGFRB-201ENST00000261799 SONP18583 2426 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 FREM1Q5H8C1 2179 aa9.58□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00694P0DN24 101 aa9.57□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 SDIM1Q6ZPB5 146 aa9.57□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 SPG11Q96JI7 2443 aa9.57□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.57□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 SMIM1B2RUZ4 78 aa9.57□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 NDUFC2O95298 119 aa9.57□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.56□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6ZRU5 148 aa9.56□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 RETNLBQ9BQ08 111 aa9.55□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 IGIPA6NJ69 53 aa9.55□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 TP73-AS1Q9UF72 201 aa9.55□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 J3KT08 172 aa9.54□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa9.54□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 LINC00315P59091 139 aa9.54□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6ZSN1 163 aa9.53□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 C22orf24Q9Y442 160 aa9.53□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa9.53□□□□□ -0.88
PDGFRB-201ENST00000261799 CSPG4Q6UVK1 2322 aa9.52□□□□□ -0.89
PDGFRB-201ENST00000261799 X6R8D5 127 aa9.52□□□□□ -0.89
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6Q795 121 aa9.51□□□□□ -0.89
PDGFRB-201ENST00000261799 Q6ZRP5 223 aa9.51□□□□□ -0.89
PDGFRB-201ENST00000261799 SHANK1Q9Y566 2161 aa9.51□□□□□ -0.89
PDGFRB-201ENST00000261799 Q8N814 137 aa9.5□□□□□ -0.89
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