RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635861.1

CLN3-241, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 1,404 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-241ENST00000635861 AMTP48728 403 aa12.03□□□□□ -0.48
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CLN3-241ENST00000635861 NUDT10Q8NFP7 164 aa12.03□□□□□ -0.48
CLN3-241ENST00000635861 NUDT11Q96G61 164 aa12.03□□□□□ -0.48
CLN3-241ENST00000635861 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
CLN3-241ENST00000635861 UQCR10Q9UDW1 63 aa12.03□□□□□ -0.48
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CLN3-241ENST00000635861 LINC01620Q4KN68 170 aa12.02□□□□□ -0.49
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CLN3-241ENST00000635861 GATD1Q8NB37 220 aa11.86□□□□□ -0.51
CLN3-241ENST00000635861 DPH3P1Q9H4G8 78 aa11.86□□□□□ -0.51
CLN3-241ENST00000635861 KIAA1644Q3SXP7 199 aa11.86□□□□□ -0.51
CLN3-241ENST00000635861 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP11.86□□□□□ -0.51
CLN3-241ENST00000635861 C20orf203Q8NBC4 194 aa11.86□□□□□ -0.51
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