RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 M0R381 172 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 HTN1P15515 57 aa9.03□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 SACSQ9NZJ4 4579 aa9.02□□□□□ -0.96
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0U1RQV1 116 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 CRYGDP07320 174 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 ETDBQ3ZM63 59 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 WFDC2Q14508 124 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 SPINK13Q1W4C9 94 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 OR5A1Q8NGJ0 315 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01587Q99440 93 aa9.02□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 SMIM2Q9BVW6 85 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 MUC4Q99102 2169 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 CEND1Q8N111 149 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 KLK5Q9Y337 293 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 RYR2Q92736 4967 aa9.01□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 S100A4P26447 101 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 C11orf45Q8TAV5 145 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 KMT2AQ03164 3969 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 IGHV4-28A0A0C4DH34 117 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 HLA-DRB4P13762 266 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa9□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 RBMY1A1P0DJD3 496 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 RBMY1CP0DJD4 496 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 RBMY1FQ15415 496 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 Q5XG85 94 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV2A0A0B4J234 112 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A0J9YX75 114 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 RASL10AQ92737 203 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 CELA1Q9UNI1 258 aa8.99□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 MGPP08493 103 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 PLNP26678 52 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 F8VRH5 84 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 SCGB3A1Q96QR1 104 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 X6R8D5 127 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV21A0A0B4J279 112 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST1H4GQ99525 98 aa8.98□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 H7C1H1 209 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 ASIPP42127 132 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 TTC32Q5I0X7 151 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 LINC01561Q8N1V8 128 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 DPH3P1Q9H4G8 78 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 JPT2Q9H910 190 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 LENEPQ9Y5L5 61 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 ORMDL2Q53FV1 153 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.97□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 C3orf84H3BNL1 204 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 GNRH2O43555 120 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 IFITM1P13164 125 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 Q8NAQ8 132 aa8.96□□□□□ -0.97
RABGEF1-209ENST00000607882 IGLL5B9A064 214 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 TOMM6Q96B49 74 aa8.96□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 C12orf74Q32Q52 190 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 C1orf158Q8N1D5 194 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 E9PLD3 99 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 AMTNQ6UX39 209 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa8.95□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 Q6ZTC4 211 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 NACAE9PAV3 2078 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 A0A1B0GX51 115 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 HTN3P15516 51 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 HERVK_113P63121 156 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.94□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 H3BMG7 143 aa8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM19A4Q96LR4 140 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 SPANXA1Q9NS26 97 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE2BQ13066 116 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE2EQ4V326 116 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 GAGE2DQ9UEU5 116 aa8.91□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF815PA8K554 130 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 LY6G6CO95867 125 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 RRN3P1Q2M238 152 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 FAM222AQ5U5X8 452 aa8.9□□□□□ -0.98
RABGEF1-209ENST00000607882 SCGB1D4Q6XE38 83 aa8.9□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms