RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 SAMD10Q9BYL1 202 aa5.1□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.1□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 PRO0255Q9UI72 69 aa5.1□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 HHLA3Q9XRX5 114 aa5.1□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 ADIRFQ15847 76 aa5.09□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 OR2D3Q8NGH3 330 aa5.09□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 OR10AG1Q8NH19 301 aa5.09□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 ISOC2Q96AB3 205 aa5.09□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 OSTCQ9NRP0 149 aa5.09□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00588Q9Y4M8 146 aa5.09□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa5.09□□□□□ -1.59
ATG4D-210ENST00000588972 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 C7orf77A4D0Y5 90 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 H3BNG1 76 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 P01737 135 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 CHTF8P0CG12 524 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 ESRGQ1W209 222 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 FAM74A4Q5TZK3 123 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 PTH2Q96A98 100 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 SFRP2Q96HF1 295 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 A8MWV9 139 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 SNAI2O43623 268 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 CXCL1P09341 107 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 IGLC6P0CF74 106 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 CCL18P55774 89 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 RPS20P60866 119 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 SLAQ13239 276 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 SPATA12Q7Z6I5 190 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 ZFP82Q8N141 532 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 BTF3L4Q96K17 158 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 IMMP2LQ96T52 175 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.07□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 PHOX2AO14813 284 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 OR5AL1P0C617 328 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 SRIP30626 198 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 SPANXN1Q5VSR9 72 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 ZNRF2Q8NHG8 242 aa5.06□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 TRBV6-4A0A1B0GX49 114 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 A8MWL6 223 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 GATCO43716 136 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 CRYGDP07320 174 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 S100PP25815 95 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 RHOHQ15669 191 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 LYPD5Q6UWN5 251 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 LYZL1Q6UWQ5 148 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 ZFP2Q6ZN57 461 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 NEGR1Q7Z3B1 354 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 RPS10P5Q9NQ39 176 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 SMCO4Q9NRQ5 59 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 V9GYV3 84 aa5.05□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 INAFM2P0DMQ5 153 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 CTRLP40313 264 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 REG3AQ06141 175 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF56Q15929 161 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 TSKUQ8WUA8 353 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 PRADC1Q9BSG0 188 aa5.04□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 MGPP08493 103 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00694P0DN24 101 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 NTF3P20783 257 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 TTC32Q5I0X7 151 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 WFDC10BQ8IUB3 73 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 AP1S3Q96PC3 154 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 UPK3BQ9BT76 320 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 NAT8BQ9UHF3 227 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.03□□□□□ -1.6
ATG4D-210ENST00000588972 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 A0A1B0GW15 77 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 F2Z2F3 143 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 SMKR1H3BMG3 65 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 S100A8P05109 93 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 SMIM17P0DL12 118 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 EVI2AP22794 236 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 LINC00315P59091 139 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 CACNG7P62955 275 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 COX19Q49B96 90 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 RASL11AQ6T310 242 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 TMEM101Q96IK0 257 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.02□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 GAS8-AS1O95177 125 aa5.01□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 RAB4BP61018 213 aa5.01□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.01□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 C20orf203Q8NBC4 194 aa5.01□□□□□ -1.61
ATG4D-210ENST00000588972 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.6 ms