RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584944.5

TRAF4-215, Transcript of TNF receptor associated factor 4, humanhuman

TSL 2

Gene TRAF4, Length 825 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4-215ENST00000584944 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
TRAF4-215ENST00000584944 REG3AQ06141 175 aa9.34□□□□□ -0.91
TRAF4-215ENST00000584944 MIAQ16674 131 aa9.34□□□□□ -0.91
TRAF4-215ENST00000584944 PRSS47A8MTI9 375 aa9.33□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 RTL8CO15255 209 aa9.33□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 ESDP10768 282 aa9.33□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 C20orf203Q8NBC4 194 aa9.33□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 CYSLTR1Q9Y271 337 aa9.33□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV4-60A0A075B6I1 120 aa9.32□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 ATP6V1G1O75348 118 aa9.32□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 RAB5BP61020 215 aa9.32□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 YPEL4Q96NS1 127 aa9.32□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 SPANXA1Q9NS26 97 aa9.32□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa9.31□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 SCO1O75880 301 aa9.31□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 ZNF664Q8N3J9 261 aa9.31□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa9.3□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 RPL39P62891 51 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 ENHOQ6UWT2 76 aa9.3□□□□□ -0.92
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TRAF4-215ENST00000584944 LINC01549A6NIU2 74 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 TRGC2P03986 189 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 SS18Q15532 418 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 C2orf66Q6UXQ4 117 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 TIMM21Q9BVV7 248 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 AP5S1Q9NUS5 200 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 PRR34Q9NV39 138 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa9.29□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 CSDC2Q9Y534 153 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 BAGE3Q86Y29 109 aa9.28□□□□□ -0.92
TRAF4-215ENST00000584944 COLCA2A8K830 154 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 LINC00614P0C842 121 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 TNP2Q05952 138 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 C18orf32Q8TCD1 76 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 C2orf88Q9BSF0 95 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa9.27□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 SCGB3A1Q96QR1 104 aa9.26□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 IFITM10A6NMD0 228 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 C1orf196B1AJZ1 125 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 XCL1P47992 114 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 TEX43Q6ZNM6 134 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 Q6ZUT4 128 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 TMEM141Q96I45 108 aa9.25□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 VCX2Q9H322 139 aa9.25□□□□□ -0.93
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TRAF4-215ENST00000584944 CCL25O15444 150 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 C14orf177Q52M58 125 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 BAALCQ8WXS3 180 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 TOMM6Q96B49 74 aa9.24□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa9.24□□□□□ -0.93
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TRAF4-215ENST00000584944 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa9.23□□□□□ -0.93
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TRAF4-215ENST00000584944 HSBP1O75506 76 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 CFAP161Q6P656 301 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.23□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 HBDP02042 147 aa9.22□□□□□ -0.93
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TRAF4-215ENST00000584944 MALP21145 153 aa9.22□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 ERASQ7Z444 233 aa9.22□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 LRP1BQ9NZR2 4599 aa9.22□□□□□ -0.93
TRAF4-215ENST00000584944 LINC01546A6NGU7 62 aa9.21□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 SPATA12Q7Z6I5 190 aa9.21□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 TIMM17AQ99595 171 aa9.21□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa9.2□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 NDUFA6P56556 154 aa9.2□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 PMCHL1Q16048 86 aa9.2□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 USP17L23D6RBM5 183 aa9.19□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 CD164L2Q6UWJ8 174 aa9.19□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.19□□□□□ -0.94
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TRAF4-215ENST00000584944 hDV102S1A0JD36 115 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 IGIPA6NJ69 53 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 COX7A2LO14548 114 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 ATP5LO75964 103 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 SEC11AP67812 179 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 Q8N814 137 aa9.18□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP9.18□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP9.17□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.17□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 LRCOL1A6NCL2 159 aa9.17□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 C16orf90A8MZG2 172 aa9.17□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 APOMO95445 188 aa9.17□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.17□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa9.17□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP9.17□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 SERF1AO75920 110 aa9.16□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 PRSS1P07477 247 aa9.15□□□□□ -0.94
TRAF4-215ENST00000584944 FOXI1Q12951 378 aa9.15□□□□□ -0.94
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