RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582232.1

GGA3-211, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2

Gene GGA3, Length 598 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-211ENST00000582232 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-30P01768 117 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-33P01772 117 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 ERASQ7Z444 233 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 FAM104AQ969W3 186 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 TIMM17AQ99595 171 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa7.78□□□□□ -1.16
GGA3-211ENST00000582232 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 NDUFA6P56556 154 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZR54 194 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 ZNF664Q8N3J9 261 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 TMEM141Q96I45 108 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 PRR34Q9NV39 138 aa7.77□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa7.76□□□□□ -1.17
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GGA3-211ENST00000582232 FAM19A2Q8N3H0 131 aa7.76□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 SCGB3A1Q96QR1 104 aa7.76□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.76□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 KLK12Q9UKR0 248 aa7.76□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 ATP5LO75964 103 aa7.75□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.75□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZUT4 128 aa7.75□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 LINC00269Q8N2A0 174 aa7.75□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.74□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 BORCS8-MEF2BH3BNR1 382 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 S100A6P06703 90 aa7.74□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 REG3AQ06141 175 aa7.74□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 MIAQ16674 131 aa7.74□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 ENHOQ6UWT2 76 aa7.74□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 AMELXQ99217 191 aa7.74□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP7.74□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 CCL25O15444 150 aa7.73□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 LEPROTL1O95214 131 aa7.73□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 Q6ZN92 141 aa7.73□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 UBE2WQ96B02 151 aa7.73□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.73□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa7.72□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 C5orf52A6NGY3 159 aa7.72□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 CRPP02741 224 aa7.72□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 TEX43Q6ZNM6 134 aa7.72□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 LINC00173Q6ZV60 143 aa7.72□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 BAALCQ8WXS3 180 aa7.72□□□□□ -1.17
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GGA3-211ENST00000582232 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.72□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 DNAH2Q9P225 4427 aa7.71□□□□□ -1.17
GGA3-211ENST00000582232 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa7.71□□□□□ -1.18
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GGA3-211ENST00000582232 IFI27L1Q96BM0 104 aa7.71□□□□□ -1.18
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GGA3-211ENST00000582232 CLPSL2Q6UWE3 100 aa7.7□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 RMI2Q96E14 147 aa7.7□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 C2orf88Q9BSF0 95 aa7.7□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 CST9LQ9H4G1 147 aa7.7□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 COX11Q9Y6N1 276 aa7.7□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.7□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.69□□□□□ -1.18
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GGA3-211ENST00000582232 UBE2D1P51668 147 aa7.69□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 SS18Q15532 418 aa7.69□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.69□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 C6orf223Q8N319 242 aa7.69□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.69□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 TM2D2Q9BX73 214 aa7.69□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 PRSS1P07477 247 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa7.68□□□□□ -1.18
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GGA3-211ENST00000582232 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP7.68□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 Q9HAA7 133 aa7.68□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 S100A2P29034 98 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 SEC11AP67812 179 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 SPATA12Q7Z6I5 190 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.67□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa7.66□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 LINC00242Q5T6M2 205 aa7.66□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 CD164L2Q6UWJ8 174 aa7.66□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP7.66□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa7.65□□□□□ -1.18
GGA3-211ENST00000582232 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7.65□□□□□ -1.18
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