RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578025.5

TSPOAP1-AS1-201, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 2,229 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CARD19Q96LW7 228 aa17.39■□□□□ 0.37
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDIP1Q9H305 208 aa17.39■□□□□ 0.37
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TIMM21Q9BVV7 248 aa17.31■□□□□ 0.36
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa17.3■□□□□ 0.36
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IL17DQ8TAD2 202 aa17.27■□□□□ 0.36
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TENM1Q9UKZ4 2725 aa17.27■□□□□ 0.36
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 VWFP04275 2813 aa17.27■□□□□ 0.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa17.27■□□□□ 0.35
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa17.27■□□□□ 0.35
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 M0QXV9 152 aa17.26■□□□□ 0.35
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 SPANXCQ9NY87 97 aa17.22■□□□□ 0.35
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 NDUFA12Q9UI09 145 aa17.22■□□□□ 0.35
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 A8MZ25 164 aa17.21■□□□□ 0.35
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa17.21■□□□□ 0.35
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 LINC01620Q4KN68 170 aa17.17■□□□□ 0.34
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP17.15■□□□□ 0.34
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 TRAV4A0A0B4J268 109 aa17.13■□□□□ 0.33
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TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAGE12FP0CL80 117 aa17.13■□□□□ 0.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAGE12GP0CL81 117 aa17.13■□□□□ 0.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GAGE12IP0CL82 117 aa17.13■□□□□ 0.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa17.13■□□□□ 0.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa17.12■□□□□ 0.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP17.12■□□□□ 0.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 ICOSQ9Y6W8 199 aa17.12■□□□□ 0.33
TSPOAP1-AS1-201ENST00000578025 RNF183Q96D59 192 aa17.12■□□□□ 0.33
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