RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566882.5

CCNDBP1-210, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,746 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM170BQ5T4T1 132 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-210ENST00000566882 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-210ENST00000566882 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-210ENST00000566882 RHOHQ15669 191 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-210ENST00000566882 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM141Q96I45 108 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-210ENST00000566882 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.28□□□□□ -1.24
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGLL5B9A064 214 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 E9PLD3 99 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPL24P83731 157 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 EDA2RQ9HAV5 297 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A0J9YXV3 536 aa7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE7O76087 117 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE12FP0CL80 117 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE12GP0CL81 117 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE12IP0CL82 117 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 H3BMG7 143 aa7.26□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRAPQ8TCY5 172 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPATA25Q9BR10 227 aa7.25□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 J3QR89 54 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 RHODO00212 210 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 CRLF1O75462 422 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 WFDC2Q14508 124 aa7.24□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE12JA6NER3 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 APOMO95445 188 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC00694P0DN24 101 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE4Q13068 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 GAGE13Q4V321 117 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 Q6ZUT4 128 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 ZNF22P17026 224 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa7.23□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 SH2D6Q7Z4S9 175 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A0J9YY99 117 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 LINC01549A6NIU2 74 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 A8MZ25 164 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 RRN3P1Q2M238 152 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 OR5A1Q8NGJ0 315 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 AMELXQ99217 191 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 STAB1Q9NY15 2570 aa7.22□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 K7EQD1 137 aa7.21□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 TAL2Q16559 108 aa7.21□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 NFE4Q86UQ8 179 aa7.21□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa7.21□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 C16orf74Q96GX8 76 aa7.21□□□□□ -1.25
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 TMEM223A0PJW6 202 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFB4AO15263 64 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 PYGO1Q9Y3Y4 419 aa7.21□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 J3QQQ9 107 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPINK8P0C7L1 97 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFB130BP0DP73 79 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFB130AP0DP74 79 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 DNAJC30Q96LL9 226 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 ETDBQ3ZM63 59 aa7.2□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 HERVK_113P61574 105 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 ARL17AQ8IVW1 177 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A1B0GWB2 263 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 INSL3P51460 131 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 TIRAPP58753 221 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2D3P61077 147 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2D2P62837 147 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 OVOL2Q9BRP0 275 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 X6R8D5 127 aa7.19□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 COX6A2Q02221 97 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-30P01768 117 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 UBE2D1P51668 147 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 FHL2Q14192 279 aa7.18□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 ANK2Q01484 3957 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 A0A0U1RRA0 63 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 H7C2G1 150 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 CFC1BP0CG36 223 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 CFC1P0CG37 223 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 DEFB135Q30KP9 77 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 C9orf66Q5T8R8 295 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 SPANXA1Q9NS26 97 aa7.17□□□□□ -1.26
CCNDBP1-210ENST00000566882 V9GYY9 64 aa7.17□□□□□ -1.26
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